More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0275 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  91.85 
 
 		 642 aa  1127    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 641 aa  1285    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 638 aa  1285    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 		 639 aa  1018    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 638 aa  1285    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.95 
 
 		 638 aa  1145    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.45 
 
 		 638 aa  1169    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.42 
 
 		 638 aa  1149    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.49 
 
 		 636 aa  917    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.84 
 
 		 638 aa  1283    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.19 
 
 		 636 aa  1028    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.15 
 
 		 638 aa  1005    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.42 
 
 		 638 aa  1149    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.35 
 
 		 638 aa  1037    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.43 
 
 		 638 aa  993    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  53.38 
 
 		 638 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  51.02 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  52.19 
 
 		 650 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  43.85 
 
 		 636 aa  538  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.08 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.471742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  37.15 
 
 		 641 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 		 645 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 645 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.8 
 
 		 645 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.79 
 
 		 640 aa  359  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 		 643 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 		 645 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 640 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  36.38 
 
 		 629 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  37.82 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  37.62 
 
 		 629 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  34.05 
 
 		 632 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 		 548 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 		 626 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.88 
 
 		 630 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  34.05 
 
 		 632 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  36.58 
 
 		 626 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  48.42 
 
 		 548 aa  290  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.94 
 
 		 548 aa  289  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  39.07 
 
 		 629 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  38 
 
 		 629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  32.78 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 628 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.74 
 
 		 624 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.52 
 
 		 626 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.89 
 
 		 628 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 		 625 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.54 
 
 		 626 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 		 629 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.79 
 
 		 643 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  38.22 
 
 		 629 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  37.55 
 
 		 630 aa  281  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  29.45 
 
 		 648 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.7 
 
 		 624 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.7 
 
 		 624 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  34.44 
 
 		 623 aa  267  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 		 637 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 		 637 aa  266  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 		 558 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.01 
 
 		 630 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 630 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001368  methyl-accepting chemotaxis protein  47.26 
 
 		 519 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 630 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.5 
 
 		 630 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.12 
 
 		 638 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 623 aa  263  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 		 634 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 630 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.41 
 
 		 712 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 630 aa  261  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  40.26 
 
 		 712 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.96 
 
 		 647 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.13 
 
 		 648 aa  257  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 647 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 630 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  36.99 
 
 		 559 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  46.02 
 
 		 634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 		 634 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 		 636 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 630 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.82 
 
 		 671 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 		 631 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3736  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 620 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.0212994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 620 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 		 674 aa  253  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 		 716 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 		 713 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 		 564 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 648 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 648 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  35.12 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 712 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3785  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 620 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0060774  normal  0.0147123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  43.71 
 
 		 568 aa  250  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  34.36 
 
 		 627 aa  250  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 		 646 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  35.4 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>