More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0099 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.49 
 
 		 636 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 		 638 aa  986    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  79.4 
 
 		 642 aa  971    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.83 
 
 		 638 aa  978    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 639 aa  1288    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.16 
 
 		 638 aa  958    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.56 
 
 		 638 aa  979    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 		 638 aa  986    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.97 
 
 		 638 aa  985    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.87 
 
 		 638 aa  983    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 		 636 aa  1029    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 		 641 aa  986    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.66 
 
 		 638 aa  1015    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.87 
 
 		 638 aa  981    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 		 638 aa  986    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  51.25 
 
 		 638 aa  611  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  50.7 
 
 		 638 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.01 
 
 		 650 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  42.68 
 
 		 636 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 		 641 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.471742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  34.22 
 
 		 641 aa  364  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 640 aa  362  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 640 aa  350  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 645 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 		 643 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 645 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 645 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  55.02 
 
 		 548 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.2 
 
 		 630 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  34.05 
 
 		 632 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 548 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.62 
 
 		 624 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 		 548 aa  293  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  37.81 
 
 		 629 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  33.64 
 
 		 632 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.61 
 
 		 624 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.61 
 
 		 624 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 624 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  33.28 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.92 
 
 		 630 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  33.13 
 
 		 629 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  31.34 
 
 		 623 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 		 625 aa  281  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.73 
 
 		 637 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  37.79 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 626 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.5 
 
 		 643 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.54 
 
 		 630 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.23 
 
 		 630 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 		 628 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.31 
 
 		 628 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.18 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 630 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001368  methyl-accepting chemotaxis protein  47.87 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  37.15 
 
 		 629 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 630 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 629 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  32.27 
 
 		 623 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  28.59 
 
 		 648 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.18 
 
 		 630 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 		 638 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 629 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 		 634 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 		 558 aa  266  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  45.43 
 
 		 568 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.43 
 
 		 626 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  46.45 
 
 		 634 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 648 aa  264  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 		 637 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  33.57 
 
 		 639 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 		 634 aa  263  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 631 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 630 aa  260  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 630 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.39 
 
 		 712 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.63 
 
 		 712 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  33.95 
 
 		 633 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.91 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  37.75 
 
 		 559 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 		 564 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 		 636 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.61 
 
 		 671 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 		 548 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 738 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  35.9 
 
 		 545 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 		 712 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 		 541 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  36.7 
 
 		 714 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  35.57 
 
 		 652 aa  253  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 554 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 		 716 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>