More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4443 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  93.91 
 
 		 624 aa  1147    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  98.24 
 
 		 624 aa  1249    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  60.86 
 
 		 643 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.83 
 
 		 628 aa  751    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.4 
 
 		 624 aa  1249    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  100 
 
 		 624 aa  1269    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  60.06 
 
 		 626 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  59.39 
 
 		 629 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  62.34 
 
 		 632 aa  791    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.29 
 
 		 625 aa  874    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  59.68 
 
 		 626 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  61.75 
 
 		 630 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  60.51 
 
 		 629 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  63.43 
 
 		 629 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  66.3 
 
 		 629 aa  840    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  60.38 
 
 		 626 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  65.13 
 
 		 630 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  75.04 
 
 		 629 aa  919    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  68.2 
 
 		 629 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  60.99 
 
 		 628 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  60.54 
 
 		 626 aa  722    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  62.97 
 
 		 632 aa  799    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  67.73 
 
 		 629 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  65.98 
 
 		 629 aa  838    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 627 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  32.8 
 
 		 623 aa  326  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 		 623 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  33.45 
 
 		 623 aa  323  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 		 695 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  32.73 
 
 		 652 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.22 
 
 		 622 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 630 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 638 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 630 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.7 
 
 		 630 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 630 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 630 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 638 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 630 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 		 626 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 622 aa  300  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  32.44 
 
 		 630 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 639 aa  297  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.6 
 
 		 632 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 636 aa  294  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 638 aa  293  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 		 623 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.61 
 
 		 630 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.18 
 
 		 626 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 631 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 		 623 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 623 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  31.1 
 
 		 623 aa  282  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.96 
 
 		 623 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 		 623 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 623 aa  280  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.73 
 
 		 623 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.73 
 
 		 623 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  35.02 
 
 		 627 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 630 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.58 
 
 		 626 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  40.13 
 
 		 642 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  37.83 
 
 		 638 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.4 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  32.06 
 
 		 633 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 638 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 638 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 		 638 aa  270  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  33.85 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.13 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.92 
 
 		 638 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 638 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 641 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.79 
 
 		 559 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.62 
 
 		 650 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.05 
 
 		 627 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 632 aa  259  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.82 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.3 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.17 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  35.79 
 
 		 638 aa  258  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.34 
 
 		 599 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  29.94 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 		 698 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  32.63 
 
 		 626 aa  252  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 624 aa  252  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 645 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 645 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5136  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  29.33 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>