More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06314 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  100 
 
 
623 aa  1263    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.28 
 
 
622 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  65.01 
 
 
623 aa  768    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.64 
 
 
622 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  57.28 
 
 
652 aa  692    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  84.91 
 
 
623 aa  1100    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.24 
 
 
622 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 
627 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
626 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  34.83 
 
 
629 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  34.66 
 
 
629 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 
625 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  35.23 
 
 
629 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  33.67 
 
 
632 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  35.57 
 
 
629 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  34.17 
 
 
632 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
629 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.67 
 
 
630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.89 
 
 
630 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.39 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
626 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  35.11 
 
 
626 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.21 
 
 
628 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  36.09 
 
 
629 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 
628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  31.6 
 
 
626 aa  318  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.99 
 
 
626 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.82 
 
 
643 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.54 
 
 
626 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  31.37 
 
 
629 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.49 
 
 
626 aa  309  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 
629 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.96 
 
 
624 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.17 
 
 
630 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 
630 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  33.99 
 
 
624 aa  303  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  33.17 
 
 
627 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 
630 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 
630 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.28 
 
 
624 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 
630 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  37.5 
 
 
627 aa  298  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.94 
 
 
624 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 
630 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 
624 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  33.01 
 
 
633 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.17 
 
 
630 aa  293  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.56 
 
 
630 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 
630 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  35.7 
 
 
626 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 
631 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 
623 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 
638 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.51 
 
 
712 aa  280  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 
630 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 
638 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 
623 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.94 
 
 
712 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  32.21 
 
 
623 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 
646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
623 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  33.04 
 
 
639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.15 
 
 
648 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  34.3 
 
 
646 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.85 
 
 
623 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.85 
 
 
623 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
713 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
623 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.2 
 
 
623 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.55 
 
 
623 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.6 
 
 
648 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.52 
 
 
714 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
623 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.5 
 
 
627 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
633 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
714 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  34.67 
 
 
628 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.95 
 
 
714 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.38 
 
 
714 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.9 
 
 
632 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 
647 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 
636 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.95 
 
 
688 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 
647 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.62 
 
 
647 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 
638 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  38.81 
 
 
714 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 
714 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.24 
 
 
688 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
715 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
738 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 
639 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 
688 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.33 
 
 
688 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 
645 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.57 
 
 
623 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.07 
 
 
647 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  38.81 
 
 
714 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>