More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4216 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  59.84 
 
 		 636 aa  742    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 647 aa  1318    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.48 
 
 		 632 aa  972    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.73 
 
 		 633 aa  1006    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 		 643 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 		 663 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  46.49 
 
 		 771 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  47.49 
 
 		 578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  49.04 
 
 		 690 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.29 
 
 		 687 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.76 
 
 		 527 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 		 525 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 		 527 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 		 527 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.94 
 
 		 626 aa  281  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  41.84 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 		 527 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 627 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.44 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 626 aa  272  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  31.79 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  35.29 
 
 		 623 aa  266  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  29.41 
 
 		 632 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.02 
 
 		 622 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.69 
 
 		 626 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 		 688 aa  259  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.88 
 
 		 633 aa  258  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  28.88 
 
 		 632 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  30.41 
 
 		 629 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.64 
 
 		 622 aa  257  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 		 623 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  41.36 
 
 		 564 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  31.57 
 
 		 623 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  33.09 
 
 		 652 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 623 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.98 
 
 		 623 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 554 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  30.53 
 
 		 629 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  30.02 
 
 		 627 aa  253  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 622 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  30.45 
 
 		 627 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.97 
 
 		 623 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.08 
 
 		 623 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 		 623 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  28.55 
 
 		 628 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.32 
 
 		 623 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.32 
 
 		 623 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.93 
 
 		 623 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 625 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 623 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.95 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  30.69 
 
 		 624 aa  248  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  28.86 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.42 
 
 		 630 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.85 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 		 554 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 555 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  36.23 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 568 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  28.86 
 
 		 629 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  29.84 
 
 		 623 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.6 
 
 		 626 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 554 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 		 554 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.03 
 
 		 628 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.97 
 
 		 554 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  28.04 
 
 		 629 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.53 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 		 630 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.25 
 
 		 630 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 		 630 aa  240  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  29.83 
 
 		 628 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.27 
 
 		 630 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.74 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.71 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.09 
 
 		 643 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.02 
 
 		 630 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 		 554 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  40.73 
 
 		 557 aa  237  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 628 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.42 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  32.25 
 
 		 626 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 		 629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.64 
 
 		 623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.77 
 
 		 624 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 568 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 633 aa  231  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>