More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1073 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
633 aa  1273    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
625 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
627 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  36.41 
 
 
626 aa  330  6e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  49.44 
 
 
650 aa  326  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
708 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
713 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 
563 aa  302  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  47.08 
 
 
566 aa  292  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  42.78 
 
 
656 aa  288  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 
656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  45.61 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
563 aa  272  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 
652 aa  261  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.37 
 
 
632 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  30.74 
 
 
639 aa  250  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 
625 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.12 
 
 
628 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 
627 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.86 
 
 
643 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  28.4 
 
 
627 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 
628 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 
630 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  29.1 
 
 
627 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
682 aa  239  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 
630 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 
630 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  29.17 
 
 
629 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.18 
 
 
630 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  32.6 
 
 
629 aa  237  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.1 
 
 
626 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
536 aa  234  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.78 
 
 
626 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 
647 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.36 
 
 
636 aa  231  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.64 
 
 
630 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
546 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 
629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 
632 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 
633 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 
622 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 
624 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 
626 aa  220  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.04 
 
 
609 aa  220  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.28 
 
 
630 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 
632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  34.51 
 
 
652 aa  216  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.65 
 
 
630 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.64 
 
 
596 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  28.36 
 
 
643 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  30.21 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.54 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.03 
 
 
601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 
626 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.2 
 
 
630 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 
630 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.67 
 
 
606 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6319  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
601 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
630 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.54 
 
 
608 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 
611 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127748  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
622 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 
630 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  26.48 
 
 
632 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 
618 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.627209  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3471  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.3 
 
 
605 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  30.81 
 
 
629 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30.87 
 
 
629 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  26.68 
 
 
632 aa  211  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3307  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  28.52 
 
 
646 aa  210  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154231  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.31 
 
 
596 aa  210  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.45 
 
 
596 aa  210  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  26.11 
 
 
626 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  28.73 
 
 
629 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  28.73 
 
 
629 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2894  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.1 
 
 
605 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.955347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.17 
 
 
624 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.28 
 
 
599 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 
599 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 
599 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
623 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  30.78 
 
 
623 aa  207  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.35 
 
 
633 aa  207  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
609 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4256  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.94 
 
 
599 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  29.42 
 
 
623 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 
599 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0036  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 
599 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1452  methyl-accepting chemotaxis protein  31.5 
 
 
595 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.19796  normal  0.220045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.5 
 
 
595 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.9 
 
 
599 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
609 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2753  methyl-accepting chemotaxis protein  31.5 
 
 
595 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0257893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.78 
 
 
599 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  41.29 
 
 
533 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
599 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.01 
 
 
660 aa  204  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 
660 aa  204  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 
623 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>