More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3759 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.09 
 
 		 554 aa  695    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.95 
 
 		 554 aa  892    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  66.42 
 
 		 554 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.15 
 
 		 568 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63 
 
 		 555 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.97 
 
 		 554 aa  714    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.98 
 
 		 554 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.8 
 
 		 554 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.94 
 
 		 554 aa  800    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 554 aa  1117    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.98 
 
 		 554 aa  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.51 
 
 		 554 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.09 
 
 		 554 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.33 
 
 		 554 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.17 
 
 		 554 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  65.09 
 
 		 554 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.9 
 
 		 558 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  67.15 
 
 		 554 aa  718    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.28 
 
 		 554 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.27 
 
 		 554 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.79 
 
 		 554 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.36 
 
 		 554 aa  722    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.51 
 
 		 554 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  42.4 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 564 aa  346  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  38.82 
 
 		 553 aa  335  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  37.43 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  37.79 
 
 		 559 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  37.61 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  37.34 
 
 		 553 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 558 aa  312  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  37.74 
 
 		 690 aa  300  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  36.04 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.79 
 
 		 544 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 		 549 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 		 561 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 687 aa  289  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 		 569 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 		 544 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.82 
 
 		 545 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  42.56 
 
 		 771 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 554 aa  279  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 		 549 aa  279  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  33.93 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  32.06 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 548 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.5 
 
 		 637 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.46 
 
 		 546 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 544 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 546 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  38.97 
 
 		 578 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 		 637 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  41.38 
 
 		 643 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 568 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  33.27 
 
 		 545 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.61 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 		 674 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 527 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 		 540 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 		 636 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 		 716 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 688 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 		 634 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 		 663 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  39.8 
 
 		 697 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  39.84 
 
 		 558 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.4 
 
 		 570 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 540 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 		 527 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  40.46 
 
 		 578 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 634 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  32.87 
 
 		 543 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  44.51 
 
 		 636 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.1 
 
 		 712 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 545 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 		 527 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 634 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 638 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  41.79 
 
 		 712 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.55 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 		 647 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>