More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2412 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.67 
 
 		 545 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 545 aa  1104    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  62.94 
 
 		 545 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.32 
 
 		 546 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.179465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.67 
 
 		 545 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.04 
 
 		 545 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.96 
 
 		 545 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.67 
 
 		 545 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.71 
 
 		 545 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.3 
 
 		 545 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.3 
 
 		 545 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  63.67 
 
 		 545 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.85 
 
 		 545 aa  693    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1653  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.06 
 
 		 538 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.92 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 548 aa  306  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 548 aa  299  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  34.99 
 
 		 545 aa  289  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  34.5 
 
 		 556 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 548 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 544 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.7 
 
 		 544 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.6 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 554 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 554 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 544 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 554 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 569 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 544 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 548 aa  256  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 554 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.96 
 
 		 554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 		 564 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 558 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 		 637 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 554 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  33.88 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 541 aa  247  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  31.38 
 
 		 549 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 560 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.51 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 554 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  33.03 
 
 		 561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 568 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 555 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 674 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  34.16 
 
 		 543 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.17 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 		 638 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 554 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.06 
 
 		 553 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.7 
 
 		 546 aa  239  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 638 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 544 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 		 637 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 		 638 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 636 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  31.6 
 
 		 553 aa  230  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 546 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 638 aa  230  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.37 
 
 		 636 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.89 
 
 		 630 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 		 639 aa  228  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  29.84 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.6 
 
 		 630 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.89 
 
 		 533 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 540 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  32.24 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  35.99 
 
 		 632 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 		 671 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 544 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 		 634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  33.48 
 
 		 557 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  30.25 
 
 		 564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  33.53 
 
 		 629 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.62 
 
 		 712 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 		 634 aa  220  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 495 aa  220  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.33 
 
 		 712 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>