More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1030 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 549 aa  1110    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  56.47 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  53.11 
 
 		 546 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.75 
 
 		 546 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.81 
 
 		 570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.03 
 
 		 547 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.28 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.13 
 
 		 545 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  67.67 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.06 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 		 563 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  63.97 
 
 		 544 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.33 
 
 		 543 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.43 
 
 		 547 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.31 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  69.49 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.69 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.95 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.06 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 		 538 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.42 
 
 		 661 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.55 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.68 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.65 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.33 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  50.12 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.09 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  58.82 
 
 		 528 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.21 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.73 
 
 		 542 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  61.93 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  57.1 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.73 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.48 
 
 		 549 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.06 
 
 		 544 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.43 
 
 		 535 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 		 541 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.71 
 
 		 632 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  61.98 
 
 		 645 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.89 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.41 
 
 		 700 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.62 
 
 		 539 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  60.77 
 
 		 392 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  57.71 
 
 		 541 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 700 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.03 
 
 		 822 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.52 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 		 548 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.13 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  55.56 
 
 		 543 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  55.99 
 
 		 541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 		 585 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.65 
 
 		 392 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.02 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 		 542 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.99 
 
 		 674 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.33 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 		 532 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.48 
 
 		 518 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 		 532 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  52.89 
 
 		 549 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.53 
 
 		 540 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 		 664 aa  320  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 544 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.71 
 
 		 666 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 		 556 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 566 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.37 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 569 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 		 544 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  36.63 
 
 		 543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  34.57 
 
 		 545 aa  306  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 		 584 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 		 544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.88 
 
 		 537 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 		 515 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.76 
 
 		 584 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 544 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.08 
 
 		 658 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 554 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 555 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 554 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 		 549 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.27 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  33.58 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 554 aa  280  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>