More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0771 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 822 aa  1636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 		 547 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 		 549 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  53.54 
 
 		 549 aa  350  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.86 
 
 		 545 aa  349  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.41 
 
 		 661 aa  347  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  57.81 
 
 		 549 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 		 533 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  50.14 
 
 		 539 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  52.79 
 
 		 533 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  49.73 
 
 		 539 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.41 
 
 		 547 aa  324  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.12 
 
 		 547 aa  324  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  49.87 
 
 		 544 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  56.19 
 
 		 549 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.86 
 
 		 540 aa  320  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.4 
 
 		 540 aa  319  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  51.48 
 
 		 632 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.9 
 
 		 546 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.56 
 
 		 543 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 		 540 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 		 533 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 		 535 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.6 
 
 		 546 aa  310  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.05 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 509 aa  308  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 		 542 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 		 544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.41 
 
 		 550 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 		 557 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.43 
 
 		 565 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 		 544 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 		 563 aa  302  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.29 
 
 		 549 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.52 
 
 		 538 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 		 542 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.44 
 
 		 544 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 		 550 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 		 518 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.31 
 
 		 518 aa  290  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  51.66 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 		 539 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  49.28 
 
 		 392 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.55 
 
 		 528 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 		 533 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 		 392 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 645 aa  276  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 569 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  47.91 
 
 		 541 aa  275  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 		 540 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 		 666 aa  273  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.13 
 
 		 388 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  46.87 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  46.24 
 
 		 543 aa  271  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 		 392 aa  271  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 		 674 aa  270  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 		 542 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.17 
 
 		 700 aa  264  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 		 700 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 		 532 aa  260  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 		 658 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.4 
 
 		 515 aa  257  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.08 
 
 		 515 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  45.5 
 
 		 549 aa  251  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 		 540 aa  243  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 		 537 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 541 aa  231  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 673 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 568 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 		 830 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  39.94 
 
 		 394 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 558 aa  214  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 		 637 aa  211  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 		 713 aa  210  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.65 
 
 		 554 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 		 545 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 		 423 aa  204  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2677  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.2 
 
 		 818 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.730239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 474 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 		 554 aa  204  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  37.39 
 
 		 545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 		 636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 557 aa  201  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.34 
 
 		 712 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 545 aa  198  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 		 674 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.63 
 
 		 552 aa  198  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.59 
 
 		 712 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 554 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 		 637 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.39 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>