More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3964 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 535 aa  1047    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.71 
 
 		 535 aa  946    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.64 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.66 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.04 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.17 
 
 		 540 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.68 
 
 		 540 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.45 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.84 
 
 		 547 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.88 
 
 		 547 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.05 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  44.36 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  57.14 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.08 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.05 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.24 
 
 		 545 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.22 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.75 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  60.84 
 
 		 533 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.49 
 
 		 542 aa  359  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  56.23 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.73 
 
 		 538 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.15 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  57.43 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.63 
 
 		 544 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  59.27 
 
 		 549 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.62 
 
 		 533 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  54.42 
 
 		 549 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.41 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.37 
 
 		 700 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.55 
 
 		 539 aa  336  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.98 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.65 
 
 		 544 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.28 
 
 		 550 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 		 570 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  48.12 
 
 		 645 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  46.37 
 
 		 541 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.51 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.24 
 
 		 700 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  53.17 
 
 		 528 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.25 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  51.53 
 
 		 392 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 		 542 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.76 
 
 		 569 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 		 392 aa  316  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 		 539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.69 
 
 		 674 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 822 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  54.17 
 
 		 546 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 		 565 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 		 392 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.53 
 
 		 388 aa  309  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 		 540 aa  309  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.28 
 
 		 632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.17 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  52.82 
 
 		 543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.28 
 
 		 666 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  51.34 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  48.54 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.99 
 
 		 563 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.26 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 		 533 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.13 
 
 		 518 aa  292  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 		 518 aa  292  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.68 
 
 		 532 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.68 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.99 
 
 		 658 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 		 549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 		 393 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.34 
 
 		 628 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 		 713 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 393 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 673 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 		 601 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 		 830 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 		 394 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  34.43 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.87 
 
 		 712 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 541 aa  220  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.49 
 
 		 712 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 423 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 637 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.72 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000818802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 541 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 		 626 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 674 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 		 636 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 		 658 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 		 637 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  38.16 
 
 		 696 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 716 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  38.44 
 
 		 674 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>