More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2326 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.96 
 
 		 547 aa  1011    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 547 aa  1099    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.39 
 
 		 549 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.57 
 
 		 550 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  55.84 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  52.74 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.35 
 
 		 674 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.54 
 
 		 540 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.45 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.47 
 
 		 547 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  53.06 
 
 		 549 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.79 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.5 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  46.17 
 
 		 544 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.5 
 
 		 550 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.36 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  62.69 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.12 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.19 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.22 
 
 		 535 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.22 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.15 
 
 		 544 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  55.04 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  51.32 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.78 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.99 
 
 		 542 aa  363  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.01 
 
 		 570 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.2 
 
 		 533 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.47 
 
 		 538 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  59.38 
 
 		 528 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.72 
 
 		 700 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  42.6 
 
 		 543 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  54.7 
 
 		 539 aa  349  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  59.21 
 
 		 645 aa  347  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.08 
 
 		 700 aa  346  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.87 
 
 		 563 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  55.39 
 
 		 541 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  44.84 
 
 		 539 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  53.08 
 
 		 392 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.02 
 
 		 392 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.41 
 
 		 539 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.02 
 
 		 392 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.46 
 
 		 533 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  53.46 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 		 542 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.69 
 
 		 388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.55 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.81 
 
 		 540 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.94 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 		 546 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.92 
 
 		 569 aa  329  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 		 565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  44.2 
 
 		 549 aa  325  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.42 
 
 		 822 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 		 518 aa  316  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.78 
 
 		 533 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 		 532 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 666 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.92 
 
 		 532 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.25 
 
 		 515 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.65 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 		 658 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 		 549 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 474 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  39.06 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.25 
 
 		 557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 637 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 541 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  38.86 
 
 		 535 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.69 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  36.04 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 571 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 		 628 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 		 601 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 422 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 393 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 541 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 545 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.54 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.74 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 636 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 		 541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 830 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 573 aa  216  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 393 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>