More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1032 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 645 aa  1279    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.62 
 
 		 543 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 		 674 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.07 
 
 		 700 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 700 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 		 658 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  50.22 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.11 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  61.98 
 
 		 549 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  57.57 
 
 		 549 aa  364  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.22 
 
 		 544 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.17 
 
 		 550 aa  359  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.21 
 
 		 547 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.25 
 
 		 547 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  61.52 
 
 		 533 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.44 
 
 		 540 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 550 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.62 
 
 		 661 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  62.85 
 
 		 549 aa  349  8e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.67 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 		 540 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  57.1 
 
 		 528 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.74 
 
 		 540 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.45 
 
 		 540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  56.62 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  44.51 
 
 		 539 aa  334  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 		 542 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 541 aa  331  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 		 535 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 		 544 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  54.49 
 
 		 541 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.27 
 
 		 542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.74 
 
 		 535 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.81 
 
 		 544 aa  326  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.02 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 664 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  44.72 
 
 		 543 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.19 
 
 		 565 aa  320  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.96 
 
 		 538 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.1 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.06 
 
 		 542 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  50.65 
 
 		 549 aa  317  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.57 
 
 		 392 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.27 
 
 		 569 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.31 
 
 		 546 aa  313  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  51.82 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  54.66 
 
 		 546 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.21 
 
 		 540 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.68 
 
 		 539 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.53 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 		 563 aa  308  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.81 
 
 		 539 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  58.2 
 
 		 549 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.57 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  53.87 
 
 		 632 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.49 
 
 		 388 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 		 518 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.75 
 
 		 822 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 		 515 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.58 
 
 		 515 aa  280  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.19 
 
 		 518 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.64 
 
 		 666 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 		 549 aa  270  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.51 
 
 		 540 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 		 626 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 		 671 aa  230  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.59 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 		 601 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 		 541 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.61 
 
 		 541 aa  223  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 		 628 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  40.84 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 		 423 aa  217  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 		 393 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 620 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  36.34 
 
 		 535 aa  211  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 		 673 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  42.43 
 
 		 633 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 		 830 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 557 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 		 393 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 		 573 aa  207  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 621 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 		 695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  38.53 
 
 		 628 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>