More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1029 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 549 aa  1093    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.31 
 
 		 550 aa  693    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  59.2 
 
 		 549 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 		 549 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.02 
 
 		 547 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.6 
 
 		 547 aa  551  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  49.38 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  66.76 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 		 547 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.75 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.51 
 
 		 543 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.05 
 
 		 540 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 		 674 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.79 
 
 		 545 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  57.79 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  63.05 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  47.76 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.45 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.59 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.12 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 		 544 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.13 
 
 		 661 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.47 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  61.06 
 
 		 528 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.86 
 
 		 535 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.24 
 
 		 541 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  49.89 
 
 		 645 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.95 
 
 		 544 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 		 542 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.05 
 
 		 539 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  57.27 
 
 		 541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.94 
 
 		 542 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.21 
 
 		 533 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.33 
 
 		 538 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.79 
 
 		 539 aa  349  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.31 
 
 		 563 aa  342  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  46.48 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.6 
 
 		 700 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.34 
 
 		 540 aa  339  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 		 392 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.19 
 
 		 822 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.26 
 
 		 565 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  54.44 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  54.73 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.77 
 
 		 700 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.68 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.35 
 
 		 533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  57.32 
 
 		 632 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.27 
 
 		 570 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.98 
 
 		 546 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.84 
 
 		 388 aa  321  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.09 
 
 		 537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.79 
 
 		 546 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  54.14 
 
 		 549 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.98 
 
 		 518 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.99 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 509 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.45 
 
 		 569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 		 666 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.22 
 
 		 549 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 		 532 aa  296  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 		 532 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.29 
 
 		 515 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.57 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 		 658 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2500  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 		 557 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 543 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 541 aa  230  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 		 626 aa  230  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 		 636 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 		 628 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 		 646 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  37.78 
 
 		 535 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 		 636 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 637 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 571 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 		 393 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  38.46 
 
 		 642 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 830 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 		 642 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 		 572 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.56 
 
 		 671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  35.28 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  29.78 
 
 		 542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 674 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  40.06 
 
 		 676 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 		 681 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>