More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3453 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 532 aa  1066    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.68 
 
 		 532 aa  1023    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  46.43 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 		 533 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  50.7 
 
 		 549 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.29 
 
 		 661 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 547 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  48.2 
 
 		 549 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 		 570 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 		 539 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 		 547 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.91 
 
 		 543 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 544 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 		 545 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.43 
 
 		 547 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 		 550 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.3 
 
 		 542 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 		 540 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  49.54 
 
 		 546 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.4 
 
 		 539 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 		 538 aa  289  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 		 546 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.22 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.47 
 
 		 569 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.59 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.96 
 
 		 535 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.57 
 
 		 632 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 535 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  50.92 
 
 		 549 aa  279  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 		 544 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.8 
 
 		 565 aa  279  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.19 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.31 
 
 		 539 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 		 550 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 700 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 		 392 aa  273  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 		 674 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 563 aa  272  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.78 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.23 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 		 700 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  47.47 
 
 		 543 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 		 509 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 		 392 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  48.16 
 
 		 541 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1303  methyl-accepting chemotaxis protein  34.28 
 
 		 494 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  44.8 
 
 		 392 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  46.51 
 
 		 541 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 		 540 aa  264  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.08 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  49.52 
 
 		 645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 		 822 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 		 544 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 537 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 		 666 aa  250  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.28 
 
 		 658 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 		 515 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 		 515 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 637 aa  240  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 		 541 aa  233  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  44.48 
 
 		 549 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 		 540 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 675 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.870162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 638 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 		 572 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.61 
 
 		 673 aa  213  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.81 
 
 		 628 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000106495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0927  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 572 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.98 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.61 
 
 		 630 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 630 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 		 630 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.83 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  35.34 
 
 		 564 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 		 634 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 630 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.91 
 
 		 630 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.29 
 
 		 540 aa  203  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.4 
 
 		 634 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>