More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3600 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  96.15 
 
 		 546 aa  1037    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 546 aa  1104    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  53.2 
 
 		 549 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  50.18 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.15 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.46 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.29 
 
 		 565 aa  362  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 		 563 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  54.93 
 
 		 533 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 		 545 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.2 
 
 		 661 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.77 
 
 		 547 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  52.35 
 
 		 528 aa  332  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.67 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 		 547 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.23 
 
 		 540 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 		 544 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  51 
 
 		 539 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.51 
 
 		 540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 544 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 544 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 		 540 aa  326  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  36.95 
 
 		 569 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 		 538 aa  324  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 		 544 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.72 
 
 		 543 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.74 
 
 		 542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 544 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 		 557 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  35.27 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.17 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.79 
 
 		 539 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.88 
 
 		 542 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.6 
 
 		 822 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.17 
 
 		 535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  51.15 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 544 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 		 539 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  33.77 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 		 549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  50.84 
 
 		 645 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 		 587 aa  302  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.78 
 
 		 544 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.28 
 
 		 544 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  36.74 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.11 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 585 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 		 664 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.87 
 
 		 632 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 		 550 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.8 
 
 		 544 aa  296  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.63 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.52 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.53 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  49.12 
 
 		 392 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.21 
 
 		 392 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 549 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 		 533 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.38 
 
 		 550 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 		 532 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.34 
 
 		 542 aa  290  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 584 aa  289  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.15 
 
 		 518 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  34.07 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 		 700 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 544 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.56 
 
 		 388 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 		 700 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.1 
 
 		 564 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 554 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 554 aa  276  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 554 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  47.75 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 554 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 554 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  47.84 
 
 		 541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  46.3 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  43.65 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  32.48 
 
 		 554 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 554 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.2 
 
 		 554 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.54 
 
 		 666 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 		 749 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.732257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 568 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>