More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2212 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.96 
 
 		 548 aa  695    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.23 
 
 		 548 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.5 
 
 		 548 aa  703    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 549 aa  1115    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 		 545 aa  342  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 		 548 aa  334  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  38.03 
 
 		 556 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 		 569 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.35 
 
 		 545 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 543 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.35 
 
 		 545 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.33 
 
 		 545 aa  323  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 545 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.16 
 
 		 545 aa  322  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.87 
 
 		 544 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 544 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 545 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 544 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.45 
 
 		 546 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  34.83 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  37.2 
 
 		 543 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  35.14 
 
 		 540 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  34.13 
 
 		 545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 545 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 		 546 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 538 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 546 aa  279  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.179465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 		 564 aa  279  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1653  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 538 aa  276  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 		 554 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 558 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.35 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  32.64 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  33.2 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.39 
 
 		 566 aa  264  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 555 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  35.83 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 554 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.57 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 		 639 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.17 
 
 		 563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  31.25 
 
 		 538 aa  256  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 568 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  32.85 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.88 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 554 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 554 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 533 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.4 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 		 638 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 554 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 638 aa  246  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 664 aa  246  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 558 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 569 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.57 
 
 		 585 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 584 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 		 636 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 570 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 		 497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.52 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.99 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.4 
 
 		 584 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.26 
 
 		 566 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 536 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 568 aa  233  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.23 
 
 		 636 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 560 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  33.5 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  42.25 
 
 		 642 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 		 563 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 		 638 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.408395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.54 
 
 		 637 aa  230  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>