More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1868 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.75 
 
 		 545 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.75 
 
 		 545 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.75 
 
 		 545 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  63.67 
 
 		 545 aa  683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.52 
 
 		 545 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  62.75 
 
 		 545 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 545 aa  1108    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.91 
 
 		 545 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.22 
 
 		 545 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.3 
 
 		 546 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.179465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.22 
 
 		 545 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.71 
 
 		 545 aa  739    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.85 
 
 		 545 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1653  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.7 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 		 538 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 548 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 548 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  33.58 
 
 		 545 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 		 548 aa  267  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 554 aa  263  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 554 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 554 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.59 
 
 		 554 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.01 
 
 		 554 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 568 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.27 
 
 		 559 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 674 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  33.15 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 569 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 554 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 		 541 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.08 
 
 		 637 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.89 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 544 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  34.6 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 554 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.43 
 
 		 637 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 541 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.41 
 
 		 546 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 558 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 638 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 		 636 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  34 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 544 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 564 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 543 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 544 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 554 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 		 546 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.18 
 
 		 712 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  40.48 
 
 		 712 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 548 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 560 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 555 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 713 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 716 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 558 aa  231  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 568 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  33.84 
 
 		 482 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 		 646 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 		 638 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 		 544 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.81 
 
 		 648 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  34.5 
 
 		 646 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 636 aa  224  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.76 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  32.78 
 
 		 557 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 		 714 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  35.52 
 
 		 632 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 639 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.39 
 
 		 643 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 		 628 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.83 
 
 		 628 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 		 668 aa  221  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  34.66 
 
 		 690 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  38.76 
 
 		 558 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  41.81 
 
 		 714 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 		 712 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32.26 
 
 		 645 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 544 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>