More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000971 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  85.9 
 
 		 553 aa  969    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 553 aa  1134    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  68.35 
 
 		 553 aa  728    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  54.74 
 
 		 558 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  37.86 
 
 		 561 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  37.68 
 
 		 561 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 560 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  36.45 
 
 		 564 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 		 554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  34.05 
 
 		 557 aa  326  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 560 aa  323  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 		 554 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  36.28 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 554 aa  299  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 554 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 558 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 		 554 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  36.86 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 568 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.48 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.67 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 558 aa  290  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.46 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.74 
 
 		 543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 569 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  32.8 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 565 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 		 544 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 544 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 		 568 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  34.39 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  34.57 
 
 		 543 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.54 
 
 		 544 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 713 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 		 636 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  42.38 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  40.27 
 
 		 712 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  42.77 
 
 		 623 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 563 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 		 674 aa  243  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 545 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 		 620 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.79 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.79 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.79 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.79 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  31.29 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 		 637 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 545 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 545 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 545 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 		 620 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 		 638 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.21 
 
 		 620 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 638 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  32.49 
 
 		 545 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  37.95 
 
 		 623 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 620 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.35 
 
 		 622 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 554 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 		 702 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 		 541 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.43 
 
 		 411 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 		 716 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 637 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 		 638 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 544 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.53 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 		 541 aa  230  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 		 631 aa  230  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.29 
 
 		 648 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.26 
 
 		 650 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>