More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2814 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 702 aa  1395    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  43.06 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 		 638 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  39.77 
 
 		 546 aa  250  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  39.14 
 
 		 545 aa  247  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 564 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  42.3 
 
 		 561 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 		 554 aa  241  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  39.57 
 
 		 553 aa  240  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  41.99 
 
 		 561 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 560 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  39.83 
 
 		 545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 		 621 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 		 674 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  37.63 
 
 		 553 aa  234  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 554 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 554 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  39.49 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 637 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 		 634 aa  229  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  36.57 
 
 		 568 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.99 
 
 		 636 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 		 541 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 554 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  37.72 
 
 		 712 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 554 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 645 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 554 aa  226  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 		 637 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 554 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 		 554 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.72 
 
 		 712 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.64 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.5 
 
 		 650 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 		 554 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  38.66 
 
 		 638 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 548 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 573 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  37.67 
 
 		 643 aa  223  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 548 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 		 558 aa  223  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 634 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 548 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  38.42 
 
 		 630 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  38.62 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  38.33 
 
 		 564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 630 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 627 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.42 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 630 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 716 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 634 aa  221  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 568 aa  221  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 554 aa  221  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 643 aa  220  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 554 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  38.29 
 
 		 630 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 645 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 568 aa  219  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.9 
 
 		 541 aa  219  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  39.64 
 
 		 545 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  38.74 
 
 		 638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 713 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.21 
 
 		 626 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 		 645 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  37.88 
 
 		 558 aa  217  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  38.67 
 
 		 580 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.59 
 
 		 630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  37.67 
 
 		 626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 		 628 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.54 
 
 		 643 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 		 629 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 438 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  36.6 
 
 		 626 aa  213  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.26 
 
 		 628 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  33.9 
 
 		 690 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  36.53 
 
 		 629 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  34.14 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 650 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>