More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0837 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.87 
 
 		 568 aa  726    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.79 
 
 		 554 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  68.1 
 
 		 554 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.69 
 
 		 554 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.48 
 
 		 554 aa  806    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.56 
 
 		 554 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.52 
 
 		 558 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  68.05 
 
 		 554 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.87 
 
 		 554 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.06 
 
 		 554 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.6 
 
 		 554 aa  715    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  66.6 
 
 		 554 aa  716    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.52 
 
 		 554 aa  717    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.55 
 
 		 554 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.05 
 
 		 554 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.87 
 
 		 554 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.74 
 
 		 554 aa  740    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.52 
 
 		 554 aa  705    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.95 
 
 		 554 aa  908    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 554 aa  1127    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.62 
 
 		 555 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.74 
 
 		 554 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.05 
 
 		 554 aa  727    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  42.03 
 
 		 564 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  42.83 
 
 		 557 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 564 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  39.04 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  38.68 
 
 		 561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  37.97 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  36.38 
 
 		 553 aa  325  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 558 aa  323  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  35.38 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 560 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  39.87 
 
 		 690 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  35.07 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.859036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 549 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 		 687 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 548 aa  290  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 		 771 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  32.25 
 
 		 556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 		 544 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  35.13 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 548 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  33.63 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  34.92 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.21 
 
 		 637 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 544 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.42 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.29 
 
 		 632 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 549 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 		 637 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 		 544 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 543 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 545 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.14 
 
 		 545 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.92 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 540 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.8 
 
 		 713 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 545 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 		 663 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  36.83 
 
 		 578 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 		 636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 545 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 643 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  33.89 
 
 		 545 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 527 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 		 674 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 570 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 716 aa  250  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 545 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 		 527 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  32.76 
 
 		 578 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  35.55 
 
 		 558 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  34.18 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 		 527 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 688 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 545 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  40.57 
 
 		 697 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 		 527 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  41.33 
 
 		 712 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 565 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.6 
 
 		 712 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 		 633 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.27 
 
 		 634 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>