More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2193 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  51.01 
 
 		 698 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 697 aa  1399    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  52.14 
 
 		 682 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 713 aa  331  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  34.12 
 
 		 714 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.82 
 
 		 712 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 688 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 714 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 688 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.73 
 
 		 714 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  33.33 
 
 		 712 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 714 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  33.52 
 
 		 714 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 		 714 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 715 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.18 
 
 		 688 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 		 714 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 688 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 738 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.12 
 
 		 716 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 712 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.36 
 
 		 716 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.77 
 
 		 695 aa  277  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 705 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 		 628 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 706 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 706 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 706 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 		 707 aa  252  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 706 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 		 706 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.03 
 
 		 706 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 705 aa  250  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  30.27 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  29.01 
 
 		 720 aa  249  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  32.42 
 
 		 706 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.8 
 
 		 554 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 		 637 aa  246  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  32.24 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  42.51 
 
 		 628 aa  241  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.23 
 
 		 706 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 705 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  42.22 
 
 		 628 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  31.63 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 626 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 554 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 		 541 aa  234  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  32.41 
 
 		 623 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 554 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 		 554 aa  233  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  41.94 
 
 		 554 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  33.39 
 
 		 624 aa  233  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  31.57 
 
 		 629 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 705 aa  233  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.45 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 554 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 554 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 		 636 aa  233  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  32.33 
 
 		 626 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.84 
 
 		 554 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 555 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.32 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 		 636 aa  231  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.79 
 
 		 554 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 554 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 554 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 706 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 554 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 554 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 627 aa  230  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 554 aa  229  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  31.38 
 
 		 629 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 637 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.55 
 
 		 622 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  32.89 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  31.52 
 
 		 632 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 554 aa  228  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  33.73 
 
 		 627 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.19 
 
 		 630 aa  227  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 639 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.48 
 
 		 626 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  38.69 
 
 		 557 aa  226  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  31.63 
 
 		 706 aa  225  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 630 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 		 634 aa  224  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 		 559 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 		 552 aa  223  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  31.43 
 
 		 627 aa  223  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 		 560 aa  223  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.75 
 
 		 630 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  32.02 
 
 		 704 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 630 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 630 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>