More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2365 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  59.8 
 
 		 688 aa  794    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  63.51 
 
 		 716 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  96.64 
 
 		 714 aa  1363    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  67.46 
 
 		 714 aa  941    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.08 
 
 		 688 aa  795    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.66 
 
 		 688 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.78 
 
 		 714 aa  1361    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.14 
 
 		 714 aa  1286    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 714 aa  1439    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  58.82 
 
 		 712 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  81.12 
 
 		 715 aa  1139    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  51.76 
 
 		 738 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.23 
 
 		 714 aa  912    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.78 
 
 		 688 aa  797    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  67.18 
 
 		 714 aa  936    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 713 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.54 
 
 		 712 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.13 
 
 		 712 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  36.47 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 716 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  36.58 
 
 		 706 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  34.63 
 
 		 701 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  36.6 
 
 		 697 aa  331  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  34.99 
 
 		 698 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.41 
 
 		 695 aa  324  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  36.32 
 
 		 682 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 706 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 706 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 706 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 		 706 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 705 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 		 706 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 713 aa  293  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 705 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 		 705 aa  292  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 706 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  36.56 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.78 
 
 		 730 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 		 707 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  31.82 
 
 		 706 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 706 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 		 634 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 730 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 741 aa  280  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 626 aa  277  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 		 640 aa  276  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.14 
 
 		 638 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 627 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 		 699 aa  273  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 		 634 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 		 637 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 		 634 aa  270  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 		 639 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  30.04 
 
 		 704 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  47.52 
 
 		 559 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 622 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 		 541 aa  263  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.4 
 
 		 636 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.78 
 
 		 622 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  36.15 
 
 		 652 aa  259  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 		 638 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 622 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 731 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 636 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 		 640 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 638 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 638 aa  256  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.5 
 
 		 627 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  43.94 
 
 		 633 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 		 674 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.84 
 
 		 773 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  46.37 
 
 		 629 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.92 
 
 		 637 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  28.42 
 
 		 740 aa  253  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  33.97 
 
 		 743 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.52 
 
 		 619 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 		 540 aa  249  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.97 
 
 		 628 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 		 568 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 		 638 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 628 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  31.61 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 		 560 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.15 
 
 		 643 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  29.11 
 
 		 779 aa  247  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  46.35 
 
 		 640 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  46.55 
 
 		 647 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 		 552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 		 638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 		 564 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.38 
 
 		 626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 		 638 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>