More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0567 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.84 
 
 		 633 aa  1284    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.68 
 
 		 633 aa  1281    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  81.8 
 
 		 634 aa  1023    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.47 
 
 		 634 aa  1069    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 633 aa  1286    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.96 
 
 		 634 aa  1025    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.8 
 
 		 638 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.53 
 
 		 633 aa  1281    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.42 
 
 		 637 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 		 636 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1479  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 		 640 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0522747  normal  0.0374393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  45.48 
 
 		 712 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.96 
 
 		 712 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 		 541 aa  297  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 713 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 		 674 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 		 716 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.08 
 
 		 541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 		 552 aa  289  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 653 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 		 640 aa  286  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  46.2 
 
 		 559 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  47.28 
 
 		 714 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 714 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 		 638 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.91 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 		 628 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  48.95 
 
 		 561 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 		 714 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 		 714 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.72 
 
 		 628 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.27 
 
 		 643 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  49.39 
 
 		 561 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 		 560 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 		 564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 		 688 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 		 619 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 548 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 		 640 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.93 
 
 		 411 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 		 639 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 		 714 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  45.2 
 
 		 688 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  44.48 
 
 		 629 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 		 688 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 715 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 		 688 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 		 636 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.47 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  37.53 
 
 		 629 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.24 
 
 		 642 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  37.31 
 
 		 629 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  45.61 
 
 		 695 aa  262  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 540 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  39 
 
 		 632 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 642 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.52 
 
 		 552 aa  259  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.22 
 
 		 647 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  44.25 
 
 		 714 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  39 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.94 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  44.25 
 
 		 714 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  40.27 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 		 645 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 		 638 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 638 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.91 
 
 		 638 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  41.35 
 
 		 630 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  44.11 
 
 		 554 aa  256  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 		 638 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 		 638 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.32 
 
 		 625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 		 555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 634 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 773 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 		 624 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  41.78 
 
 		 633 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  45.05 
 
 		 738 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  44.8 
 
 		 647 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 		 568 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 626 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 		 545 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 619 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  42.44 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  46.45 
 
 		 642 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 		 645 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.8 
 
 		 572 aa  253  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 		 645 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  42.24 
 
 		 546 aa  252  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 		 639 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  44.85 
 
 		 624 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  38.99 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 		 621 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>