More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5020 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.28 
 
 
638 aa  1232    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
638 aa  1254    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.39 
 
 
638 aa  968    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.04 
 
 
638 aa  1107    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  61.16 
 
 
638 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  61.16 
 
 
638 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  69.59 
 
 
638 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  55.05 
 
 
639 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 
640 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  53.98 
 
 
629 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  52.59 
 
 
633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 
619 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  54.33 
 
 
647 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.37 
 
 
639 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.04 
 
 
640 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  51.33 
 
 
640 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.75 
 
 
639 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 
639 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.43 
 
 
639 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  53.1 
 
 
647 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.79 
 
 
640 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.24 
 
 
739 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  49.85 
 
 
647 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.93 
 
 
647 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  50.54 
 
 
647 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
647 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
647 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 
639 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
642 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  44.46 
 
 
642 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 
681 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  43.59 
 
 
676 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 
626 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 
634 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.78 
 
 
285 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.61 
 
 
650 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
654 aa  342  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  40.09 
 
 
652 aa  330  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 
632 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
544 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 
541 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
646 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  47.78 
 
 
541 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
646 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 
541 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
646 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
541 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.95 
 
 
655 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
522 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 
541 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
425 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
541 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.34 
 
 
637 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
674 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49 
 
 
543 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 
541 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
637 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
555 aa  280  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
541 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.28 
 
 
646 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  45.48 
 
 
546 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.79 
 
 
541 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
541 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 
541 aa  277  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 
541 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
540 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  45.45 
 
 
712 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
541 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 
570 aa  273  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.8 
 
 
541 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
716 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  44.89 
 
 
712 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
638 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  47.48 
 
 
541 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.5 
 
 
540 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
636 aa  267  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
542 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  46.43 
 
 
541 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 
646 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
541 aa  266  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
552 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
546 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  45.65 
 
 
541 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
713 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
679 aa  264  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.7 
 
 
523 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 
634 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  47.09 
 
 
541 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
541 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 
714 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
541 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
541 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.92 
 
 
541 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  43.75 
 
 
634 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  45.73 
 
 
541 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
624 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
539 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  45.12 
 
 
539 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
542 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
541 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>