More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0380 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.16 
 
 
638 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.85 
 
 
638 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.29 
 
 
638 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  89.18 
 
 
638 aa  1073    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
638 aa  1259    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  62.23 
 
 
638 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.16 
 
 
638 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  55.31 
 
 
640 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  55.48 
 
 
629 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  56.65 
 
 
639 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  51.57 
 
 
633 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 
619 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.8 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  52.13 
 
 
640 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.17 
 
 
647 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  51.55 
 
 
647 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.04 
 
 
639 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.49 
 
 
639 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.49 
 
 
639 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.83 
 
 
639 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.4 
 
 
640 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
739 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
647 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
639 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  48.37 
 
 
647 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 
647 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 
647 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  43.36 
 
 
642 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  47.21 
 
 
647 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.12 
 
 
650 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  42.53 
 
 
676 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
626 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  61.06 
 
 
681 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.23 
 
 
285 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.553976  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
634 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 
654 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 
632 aa  316  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  46.34 
 
 
652 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  46.45 
 
 
541 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
541 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
522 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
544 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
541 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 
541 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
541 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.94 
 
 
655 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 
646 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  41.42 
 
 
541 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.69 
 
 
674 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48 
 
 
425 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
541 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
541 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.63 
 
 
637 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 
637 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  48.82 
 
 
541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  47.32 
 
 
541 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  44.44 
 
 
712 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
541 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  46.02 
 
 
546 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
541 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
541 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
638 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
542 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  44.15 
 
 
712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 
646 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.9 
 
 
636 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 
679 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.52 
 
 
541 aa  266  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
541 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  42.06 
 
 
546 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
716 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
624 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.92 
 
 
714 aa  264  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
541 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
570 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 
555 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
540 aa  263  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
543 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
541 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  46.5 
 
 
541 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
713 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 
541 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.66 
 
 
552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  45.43 
 
 
539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.37 
 
 
523 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  37.37 
 
 
542 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
541 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
541 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 
540 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  47.11 
 
 
714 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  47.11 
 
 
714 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.3 
 
 
646 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  44.32 
 
 
559 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
541 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 
715 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
541 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>