More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0447 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.21 
 
 
541 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  77.63 
 
 
541 aa  839    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.4 
 
 
541 aa  698    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.4 
 
 
541 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  76.71 
 
 
541 aa  809    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
541 aa  1073    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.21 
 
 
541 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  58.81 
 
 
541 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  52.21 
 
 
541 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 
541 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  52.31 
 
 
541 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  52.21 
 
 
541 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  52.12 
 
 
541 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  52.12 
 
 
541 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 
541 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.6 
 
 
541 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.05 
 
 
541 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  48.91 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.05 
 
 
541 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.5 
 
 
425 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
540 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  49.45 
 
 
541 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  45.62 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  47.87 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  44.99 
 
 
541 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.26 
 
 
570 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  47.61 
 
 
546 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.98 
 
 
542 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  62.4 
 
 
550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  45.09 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  63.84 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  45.67 
 
 
542 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 
541 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
546 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.78 
 
 
539 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
539 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  43.96 
 
 
542 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.88 
 
 
539 aa  363  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
542 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 
539 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  41.56 
 
 
557 aa  346  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.99 
 
 
550 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.99 
 
 
541 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  42.65 
 
 
542 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.47 
 
 
558 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.7 
 
 
546 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 
540 aa  335  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 
540 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.6 
 
 
541 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
640 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  46.05 
 
 
633 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.77 
 
 
640 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  44.42 
 
 
629 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.58 
 
 
638 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.58 
 
 
638 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
557 aa  286  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.3 
 
 
638 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.63 
 
 
619 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
642 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  39.26 
 
 
642 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
638 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
638 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 
647 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.75 
 
 
674 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
637 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  46.15 
 
 
647 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
543 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
634 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
639 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  46.46 
 
 
638 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
681 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
639 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
639 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  44.31 
 
 
647 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  34.05 
 
 
546 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
639 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.08 
 
 
541 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
640 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
639 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  44.71 
 
 
676 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  44.63 
 
 
640 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 
647 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 
647 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  47.04 
 
 
647 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 
647 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
544 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 
555 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
650 aa  252  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
739 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 
639 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 
523 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
638 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
679 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
634 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>