More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1450 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 706 aa  1421    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 		 720 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  38.24 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  38.04 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 715 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 714 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 688 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.89 
 
 		 714 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.38 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 714 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 		 714 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 714 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 688 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 712 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 738 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.47 
 
 		 716 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  31.43 
 
 		 712 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.97 
 
 		 712 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  32.19 
 
 		 701 aa  332  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 		 713 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 716 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.69 
 
 		 695 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 699 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.66 
 
 		 706 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.95 
 
 		 707 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 705 aa  253  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.07 
 
 		 705 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  31.63 
 
 		 697 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.1 
 
 		 706 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.1 
 
 		 706 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 731 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.1 
 
 		 706 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  32.12 
 
 		 698 aa  238  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  29.26 
 
 		 706 aa  237  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 		 568 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 713 aa  236  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 706 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 		 706 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 		 705 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  31.03 
 
 		 682 aa  233  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 637 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  39.88 
 
 		 559 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.63 
 
 		 730 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  35.49 
 
 		 634 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 		 554 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  40 
 
 		 545 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 		 627 aa  227  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  27.65 
 
 		 743 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.82 
 
 		 706 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 		 558 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 		 645 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  38.81 
 
 		 546 aa  223  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.43 
 
 		 741 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.99 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  37.6 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 554 aa  220  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  34.34 
 
 		 623 aa  220  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 		 560 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 634 aa  219  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 		 554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 554 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.86 
 
 		 554 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  27.66 
 
 		 704 aa  217  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.67 
 
 		 730 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 		 554 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.85 
 
 		 549 aa  217  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.57 
 
 		 626 aa  217  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 		 554 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.23 
 
 		 568 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 		 640 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  32.92 
 
 		 626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  39.39 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.94 
 
 		 554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.94 
 
 		 554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.41 
 
 		 626 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 640 aa  214  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  32.26 
 
 		 630 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 554 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 		 554 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 		 674 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 		 541 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 555 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 		 637 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 638 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  36.83 
 
 		 545 aa  213  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>