More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3161 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.96 
 
 
730 aa  1022    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.69 
 
 
741 aa  1071    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
731 aa  1465    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.41 
 
 
730 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  39.97 
 
 
740 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  38.43 
 
 
713 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  39.22 
 
 
779 aa  465  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.66 
 
 
566 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2682  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121525  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  37.79 
 
 
778 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.35 
 
 
567 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.57 
 
 
562 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.15 
 
 
670 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.35 
 
 
655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.48 
 
 
561 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.4 
 
 
561 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.21 
 
 
566 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  66.49 
 
 
716 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.45 
 
 
675 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  63.61 
 
 
688 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  65.75 
 
 
688 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  67.21 
 
 
561 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  64.03 
 
 
565 aa  435  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.1 
 
 
673 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.07 
 
 
561 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.9 
 
 
587 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.14 
 
 
563 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.38 
 
 
563 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.5 
 
 
674 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.3 
 
 
688 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.58 
 
 
672 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.14 
 
 
572 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  68.25 
 
 
566 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  65.51 
 
 
568 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  68.86 
 
 
674 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.38 
 
 
689 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.92 
 
 
563 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.89 
 
 
563 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.28 
 
 
563 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.9 
 
 
698 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  65.85 
 
 
565 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  63.89 
 
 
563 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.17 
 
 
568 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.26 
 
 
564 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.14 
 
 
563 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.47 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  65.06 
 
 
552 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.85 
 
 
688 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80 
 
 
560 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  61.66 
 
 
656 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  66.57 
 
 
556 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  68.29 
 
 
561 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.45 
 
 
563 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  66.31 
 
 
602 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  67.75 
 
 
563 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  61.58 
 
 
656 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  66.57 
 
 
564 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.94 
 
 
568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.59 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.54 
 
 
567 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  63.49 
 
 
542 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  71.96 
 
 
691 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.12 
 
 
656 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  64.14 
 
 
714 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.51 
 
 
563 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  67.48 
 
 
563 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.83 
 
 
563 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  65.04 
 
 
675 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.3 
 
 
567 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  60.63 
 
 
561 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.05 
 
 
656 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  68.09 
 
 
716 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.21 
 
 
563 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.23 
 
 
563 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  62.06 
 
 
577 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.47 
 
 
563 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.02 
 
 
691 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  78.97 
 
 
562 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5329  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
691 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.21 
 
 
428 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  57.6 
 
 
564 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.24 
 
 
691 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  69.78 
 
 
707 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  59.71 
 
 
569 aa  369  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.54 
 
 
698 aa  364  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 
698 aa  363  6e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  59.08 
 
 
676 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
823 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0346871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.97 
 
 
567 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 
665 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.23 
 
 
567 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.2 
 
 
450 aa  336  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.3 
 
 
674 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.03 
 
 
568 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.98 
 
 
667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.8 
 
 
681 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.8 
 
 
563 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.38 
 
 
653 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
564 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 
681 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>