More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0530 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  61.52 
 
 
561 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
569 aa  1148    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  92.02 
 
 
564 aa  1053    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.96 
 
 
716 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  62.86 
 
 
716 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  57.75 
 
 
714 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.42 
 
 
562 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.77 
 
 
566 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.18 
 
 
567 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.22 
 
 
565 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.53 
 
 
566 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  55.29 
 
 
565 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  59.65 
 
 
552 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.71 
 
 
731 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  63.35 
 
 
561 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.04 
 
 
561 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.07 
 
 
673 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.83 
 
 
741 aa  363  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  56.5 
 
 
568 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.4 
 
 
655 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  55.5 
 
 
674 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  56.43 
 
 
564 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.45 
 
 
672 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.08 
 
 
670 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.09 
 
 
674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
688 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.96 
 
 
587 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  60.12 
 
 
556 aa  356  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.29 
 
 
688 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  55.47 
 
 
566 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.32 
 
 
688 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.98 
 
 
560 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56 
 
 
656 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  53.58 
 
 
688 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
656 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  62.93 
 
 
542 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.62 
 
 
572 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.18 
 
 
563 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  56.32 
 
 
602 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.87 
 
 
561 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.25 
 
 
568 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.18 
 
 
561 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  54.03 
 
 
656 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 
689 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.37 
 
 
563 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 
577 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.72 
 
 
656 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.03 
 
 
563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.61 
 
 
563 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69 
 
 
563 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.73 
 
 
730 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.1 
 
 
698 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.06 
 
 
568 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.07 
 
 
428 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.1 
 
 
563 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.65 
 
 
675 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
563 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.43 
 
 
563 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.01 
 
 
567 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.29 
 
 
573 aa  336  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  67.9 
 
 
563 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.63 
 
 
564 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  58.4 
 
 
675 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  54.47 
 
 
561 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  66.67 
 
 
562 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
563 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
730 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.53 
 
 
567 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.51 
 
 
563 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.12 
 
 
563 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  58.13 
 
 
691 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  68.27 
 
 
563 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.25 
 
 
563 aa  320  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.18 
 
 
563 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  55.91 
 
 
707 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.99 
 
 
698 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.37 
 
 
691 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.93 
 
 
563 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.17 
 
 
691 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  49.6 
 
 
698 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  50.87 
 
 
676 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.96 
 
 
563 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
567 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.89 
 
 
674 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
568 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
567 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.84 
 
 
681 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.8 
 
 
561 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.01 
 
 
667 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
665 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 
653 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 
450 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.63 
 
 
681 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 
564 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.51 
 
 
598 aa  265  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
686 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
540 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
565 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.4 
 
 
566 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 
568 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>