More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0061 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  61.55 
 
 
676 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
674 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
673 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
672 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 
670 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
675 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
674 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.79 
 
 
567 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  44.86 
 
 
675 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  54.98 
 
 
688 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.82 
 
 
562 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.18 
 
 
565 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.25 
 
 
587 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.68 
 
 
566 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  60.83 
 
 
688 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.45 
 
 
688 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.65 
 
 
688 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.65 
 
 
566 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.89 
 
 
689 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.54 
 
 
567 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
674 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  52.23 
 
 
656 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.45 
 
 
542 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  59.73 
 
 
566 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.43 
 
 
563 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.95 
 
 
572 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.58 
 
 
573 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  53.5 
 
 
656 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  51.9 
 
 
565 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.52 
 
 
567 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.67 
 
 
655 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.21 
 
 
656 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  55.45 
 
 
568 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.7 
 
 
568 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.83 
 
 
561 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.13 
 
 
560 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  59.46 
 
 
577 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  59.32 
 
 
552 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.16 
 
 
567 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.8 
 
 
561 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  57.91 
 
 
561 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.22 
 
 
730 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.57 
 
 
561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.78 
 
 
698 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.3 
 
 
731 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.22 
 
 
656 aa  354  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 
602 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  58.65 
 
 
698 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  56.33 
 
 
563 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.07 
 
 
716 aa  351  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.18 
 
 
563 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.57 
 
 
730 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.87 
 
 
563 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.48 
 
 
568 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.94 
 
 
563 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.57 
 
 
564 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  58.96 
 
 
691 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  60.62 
 
 
556 aa  346  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.37 
 
 
741 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.92 
 
 
698 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.62 
 
 
563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.35 
 
 
563 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.95 
 
 
567 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.77 
 
 
563 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
568 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  55.16 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.44 
 
 
563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58 
 
 
667 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  53.78 
 
 
691 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.28 
 
 
563 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.43 
 
 
681 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.96 
 
 
691 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  59.04 
 
 
716 aa  333  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.43 
 
 
681 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.59 
 
 
563 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.73 
 
 
563 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.99 
 
 
563 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.11 
 
 
689 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.76 
 
 
561 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  53.37 
 
 
714 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  55.21 
 
 
562 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.72 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  55.16 
 
 
561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.03 
 
 
564 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  57.34 
 
 
707 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
563 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  50.8 
 
 
564 aa  312  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.84 
 
 
564 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.67 
 
 
686 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.74 
 
 
559 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 
540 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  52.89 
 
 
569 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.95 
 
 
450 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2743  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 
579 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 
559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  54.59 
 
 
563 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.7 
 
 
563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.34 
 
 
561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  51.34 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>