More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0772 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
561 aa  1103    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.04 
 
 
563 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  56.48 
 
 
563 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.37 
 
 
563 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.6 
 
 
563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.13 
 
 
563 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.27 
 
 
563 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
563 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  54.55 
 
 
561 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.6 
 
 
563 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 
563 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.33 
 
 
563 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  55.42 
 
 
563 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.46 
 
 
563 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.79 
 
 
564 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 
563 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  54.8 
 
 
562 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
562 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 
560 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
562 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
566 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2047  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 
562 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.759486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  63.88 
 
 
707 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  61.21 
 
 
691 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
566 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.476321  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.71 
 
 
567 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.72 
 
 
672 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  55.32 
 
 
565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
562 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  55.15 
 
 
688 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.71 
 
 
566 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.64 
 
 
688 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.51 
 
 
673 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.99 
 
 
675 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.88 
 
 
731 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  56.56 
 
 
565 aa  349  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.98 
 
 
667 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  54.28 
 
 
688 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.72 
 
 
688 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.57 
 
 
542 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.93 
 
 
568 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.49 
 
 
655 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.96 
 
 
656 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
568 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.64 
 
 
568 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.8 
 
 
689 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.88 
 
 
561 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  53.62 
 
 
656 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.4 
 
 
691 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.8 
 
 
681 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.71 
 
 
674 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 
689 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 
566 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.82 
 
 
563 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.15 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  54.09 
 
 
676 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.95 
 
 
563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.51 
 
 
573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.64 
 
 
691 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 
656 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  58 
 
 
561 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.67 
 
 
686 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.15 
 
 
674 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 
561 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 
561 aa  334  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.81 
 
 
716 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.76 
 
 
587 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.91 
 
 
698 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 
681 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.81 
 
 
670 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.02 
 
 
567 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  56.25 
 
 
552 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
572 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 
567 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.91 
 
 
561 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  54.52 
 
 
674 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.96 
 
 
730 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  56.82 
 
 
556 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.74 
 
 
563 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
741 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 
602 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.96 
 
 
567 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.92 
 
 
730 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.39 
 
 
561 aa  319  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  53.26 
 
 
577 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.18 
 
 
698 aa  319  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
562 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.4 
 
 
568 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.92 
 
 
564 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 
694 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  52.11 
 
 
698 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.15 
 
 
561 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.65 
 
 
567 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
561 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 
563 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  48.3 
 
 
714 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 
562 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0448901  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2285  chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
562 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.0714982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>