More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4118 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
567 aa  1101    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.24 
 
 
675 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.91 
 
 
672 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  65.81 
 
 
674 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.82 
 
 
673 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.55 
 
 
670 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.27 
 
 
560 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.93 
 
 
567 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.79 
 
 
674 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  66.5 
 
 
675 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.39 
 
 
568 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  67.68 
 
 
688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  51.72 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.78 
 
 
562 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.03 
 
 
561 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.86 
 
 
688 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  65.23 
 
 
561 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.31 
 
 
561 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.71 
 
 
655 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.77 
 
 
563 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.16 
 
 
587 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.89 
 
 
566 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.76 
 
 
688 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  64.93 
 
 
566 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  59.06 
 
 
565 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.4 
 
 
566 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  67.14 
 
 
688 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.02 
 
 
561 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  63.32 
 
 
568 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.08 
 
 
698 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  63.06 
 
 
602 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.16 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  62.47 
 
 
565 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.24 
 
 
689 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
568 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.71 
 
 
656 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  61.36 
 
 
552 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  61.21 
 
 
656 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.9 
 
 
572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.54 
 
 
731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  62.4 
 
 
656 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.89 
 
 
730 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.11 
 
 
698 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.46 
 
 
567 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.3 
 
 
716 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  61.29 
 
 
564 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.47 
 
 
563 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.76 
 
 
563 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  60.56 
 
 
698 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 
714 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  62.5 
 
 
556 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  55.86 
 
 
676 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  63.98 
 
 
561 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  59.51 
 
 
542 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  62.67 
 
 
691 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.29 
 
 
730 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.05 
 
 
563 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.06 
 
 
563 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.78 
 
 
563 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.99 
 
 
563 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  61.82 
 
 
563 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 
567 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.52 
 
 
656 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.06 
 
 
564 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  62.29 
 
 
716 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.7 
 
 
563 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 
563 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  53.83 
 
 
561 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.93 
 
 
563 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.13 
 
 
691 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 
563 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.54 
 
 
674 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.92 
 
 
691 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.64 
 
 
741 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
665 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.8 
 
 
563 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  52.97 
 
 
563 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.7 
 
 
563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  60.52 
 
 
707 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  58.99 
 
 
562 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.99 
 
 
681 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.46 
 
 
428 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.44 
 
 
567 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.12 
 
 
563 aa  349  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.99 
 
 
681 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.41 
 
 
667 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.74 
 
 
563 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.7 
 
 
686 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  55.01 
 
 
564 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  55.01 
 
 
569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.51 
 
 
689 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.8 
 
 
568 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.17 
 
 
564 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2743  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 
579 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.81 
 
 
653 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.51 
 
 
565 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 
561 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 
559 aa  316  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.74 
 
 
556 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>