More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1025 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.32 
 
 
681 aa  705    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.12 
 
 
689 aa  914    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.34 
 
 
686 aa  916    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.02 
 
 
667 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
681 aa  1345    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
688 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  40.63 
 
 
688 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 
688 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 
689 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
688 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.09 
 
 
567 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.24 
 
 
587 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  57.71 
 
 
552 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.01 
 
 
655 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 
568 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.78 
 
 
567 aa  363  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.71 
 
 
567 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.14 
 
 
566 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.74 
 
 
573 aa  354  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 
673 aa  351  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.21 
 
 
563 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  54.55 
 
 
676 aa  350  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  54.17 
 
 
656 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.99 
 
 
567 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  55.03 
 
 
656 aa  347  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 
602 aa  346  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.14 
 
 
675 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  50.79 
 
 
565 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 
656 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
562 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.55 
 
 
656 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 
672 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 
670 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.29 
 
 
698 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.87 
 
 
568 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.68 
 
 
564 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  52.34 
 
 
674 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.14 
 
 
698 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
566 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.03 
 
 
566 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  51.19 
 
 
565 aa  336  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  53.07 
 
 
698 aa  334  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
665 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.75 
 
 
568 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
563 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
674 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.2 
 
 
563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54 
 
 
568 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.78 
 
 
561 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.82 
 
 
563 aa  326  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.42 
 
 
731 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.77 
 
 
563 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.52 
 
 
563 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.9 
 
 
561 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.73 
 
 
542 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.99 
 
 
561 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  52.3 
 
 
577 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 
563 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  52.22 
 
 
691 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 
563 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
561 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.38 
 
 
741 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.74 
 
 
674 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 
563 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  52.99 
 
 
556 aa  317  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.02 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.67 
 
 
564 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
572 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.52 
 
 
730 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 
563 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  54.89 
 
 
707 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  49.61 
 
 
675 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  49.47 
 
 
561 aa  310  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  48.05 
 
 
714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.87 
 
 
563 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
563 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.89 
 
 
567 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.27 
 
 
560 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.75 
 
 
561 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.33 
 
 
716 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 
730 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.91 
 
 
691 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.47 
 
 
563 aa  300  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
691 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 
540 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.92 
 
 
559 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.24 
 
 
561 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
563 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  47.45 
 
 
566 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.55 
 
 
564 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5044  methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  52.41 
 
 
662 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.859604  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.31 
 
 
653 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
450 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.4 
 
 
563 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 
563 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  50.28 
 
 
562 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.91 
 
 
586 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2743  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
579 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 
565 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  49.18 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>