More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5165 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.56 
 
 
540 aa  934    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
559 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1739  chemotaxis sensory transducer  58.5 
 
 
559 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  50.62 
 
 
577 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
568 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.96 
 
 
563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0869  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  45.25 
 
 
662 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0868  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  46.07 
 
 
571 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0528119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
562 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 
566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
567 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.72 
 
 
573 aa  323  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
566 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  54.05 
 
 
688 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  52.62 
 
 
688 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
563 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
566 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.21 
 
 
689 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  38.6 
 
 
565 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 
675 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
567 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.93 
 
 
676 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  48.54 
 
 
565 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.07 
 
 
567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 
688 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
688 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.04 
 
 
674 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.56 
 
 
568 aa  300  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
572 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
561 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
674 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
672 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.32 
 
 
542 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.81 
 
 
674 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
561 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.81 
 
 
656 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  50.14 
 
 
552 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.92 
 
 
681 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.07 
 
 
655 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
673 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.1 
 
 
563 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
567 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
561 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
568 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 
670 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.58 
 
 
667 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
602 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
568 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  39.06 
 
 
561 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 
656 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  48.48 
 
 
691 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
686 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 
656 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
656 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
731 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.65 
 
 
561 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.49 
 
 
716 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
567 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.01 
 
 
681 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.99 
 
 
730 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.12 
 
 
665 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.01 
 
 
563 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
730 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 
560 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
698 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 
563 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 
563 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
563 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
587 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
691 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 
561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.63 
 
 
564 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
689 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
561 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.48 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
563 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2743  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
579 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
698 aa  270  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  45.04 
 
 
698 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
562 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
691 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
558 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  48.99 
 
 
707 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 
562 aa  267  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 
741 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.27 
 
 
561 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
563 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.01 
 
 
556 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  45.88 
 
 
675 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
563 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 
556 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
557 aa  264  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
562 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 
561 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.96 
 
 
428 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
561 aa  263  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 
566 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  40.29 
 
 
556 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
586 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>