More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5044 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5044  methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  100 
 
 
662 aa  1285    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.859604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 
665 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 
665 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.95 
 
 
655 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 
656 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  41.7 
 
 
656 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
656 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
656 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.76 
 
 
567 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.64 
 
 
567 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.62 
 
 
568 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  53.89 
 
 
688 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.82 
 
 
688 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.49 
 
 
689 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55 
 
 
689 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.27 
 
 
560 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  52.47 
 
 
698 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.49 
 
 
667 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 
670 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  54.21 
 
 
688 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.7 
 
 
587 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 
573 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.53 
 
 
688 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.24 
 
 
562 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.77 
 
 
568 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.27 
 
 
568 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  52.91 
 
 
602 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.92 
 
 
698 aa  316  9e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.95 
 
 
673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  52.12 
 
 
552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  46.4 
 
 
676 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
674 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.23 
 
 
567 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
681 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  50.66 
 
 
577 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.49 
 
 
561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
686 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.4 
 
 
566 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 
561 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.67 
 
 
563 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
672 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.42 
 
 
681 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.39 
 
 
568 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.03 
 
 
564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.32 
 
 
567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.14 
 
 
698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.93 
 
 
567 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
675 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.66 
 
 
561 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
565 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
565 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
566 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.81 
 
 
542 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 
674 aa  294  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 
731 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.13 
 
 
563 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.35 
 
 
563 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.72 
 
 
563 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
566 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  40 
 
 
561 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
561 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.6 
 
 
563 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.98 
 
 
563 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.68 
 
 
561 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  48.3 
 
 
675 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 
644 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.93 
 
 
674 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.27 
 
 
730 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
563 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.02 
 
 
563 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
563 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.63 
 
 
716 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.02 
 
 
691 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.86 
 
 
564 aa  277  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 
714 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
564 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 
563 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
572 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  48.81 
 
 
688 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
563 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
741 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  47.78 
 
 
691 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  49.15 
 
 
556 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.22 
 
 
691 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 
730 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.95 
 
 
561 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  49.28 
 
 
707 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
561 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
586 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  49 
 
 
562 aa  260  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
563 aa  260  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
561 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.44 
 
 
563 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.18 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 
563 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.93 
 
 
564 aa  253  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
566 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>