More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1867 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  58 
 
 
716 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  57.4 
 
 
716 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
714 aa  1454    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.34 
 
 
566 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.7 
 
 
566 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  64.27 
 
 
561 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  62.93 
 
 
566 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  58.46 
 
 
565 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.54 
 
 
670 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.14 
 
 
562 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.32 
 
 
672 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.26 
 
 
567 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  60.21 
 
 
674 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  61.88 
 
 
688 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  59.08 
 
 
564 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  59.78 
 
 
565 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.76 
 
 
688 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.14 
 
 
731 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.2 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  60.64 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.08 
 
 
673 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.97 
 
 
675 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.41 
 
 
688 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.86 
 
 
561 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
561 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.39 
 
 
730 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.42 
 
 
689 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.25 
 
 
563 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.37 
 
 
655 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.65 
 
 
567 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  58.78 
 
 
563 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.1 
 
 
730 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  59.27 
 
 
569 aa  389  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  62.75 
 
 
561 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  56.04 
 
 
568 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.32 
 
 
561 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
563 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  57.18 
 
 
602 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.45 
 
 
674 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.67 
 
 
587 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  61.89 
 
 
552 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.91 
 
 
573 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.97 
 
 
560 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.77 
 
 
698 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.88 
 
 
563 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.97 
 
 
568 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.5 
 
 
564 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.87 
 
 
568 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.98 
 
 
563 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 
563 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  58.45 
 
 
577 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.9 
 
 
741 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.78 
 
 
563 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.62 
 
 
656 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.67 
 
 
563 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.03 
 
 
572 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  56.68 
 
 
656 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  57.22 
 
 
563 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
691 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  55.96 
 
 
675 aa  363  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.11 
 
 
656 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.99 
 
 
563 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  60.06 
 
 
542 aa  359  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  54.52 
 
 
656 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  56.42 
 
 
564 aa  357  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.15 
 
 
563 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.62 
 
 
691 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  54.29 
 
 
561 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 
563 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.42 
 
 
567 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  56.76 
 
 
691 aa  347  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.21 
 
 
563 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.17 
 
 
556 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  53.72 
 
 
698 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.99 
 
 
563 aa  340  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.45 
 
 
698 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.44 
 
 
428 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.67 
 
 
563 aa  330  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  66.31 
 
 
562 aa  329  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.36 
 
 
567 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  57.06 
 
 
707 aa  320  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  52.67 
 
 
676 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.45 
 
 
563 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
568 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
667 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.37 
 
 
674 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
665 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 
681 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.57 
 
 
681 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.85 
 
 
567 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2022  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.49 
 
 
748 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.78 
 
 
653 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.48 
 
 
564 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 
686 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
689 aa  295  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.04 
 
 
565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.51 
 
 
561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.55 
 
 
450 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
556 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
556 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>