More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2023 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
823 aa  1669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0346871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  37.19 
 
 
778 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
730 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 
741 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
731 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.76 
 
 
730 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  40.5 
 
 
779 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  42.46 
 
 
740 aa  343  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
713 aa  343  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2682  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 
723 aa  331  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121525  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  31.4 
 
 
712 aa  210  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 
837 aa  207  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
965 aa  200  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 
713 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.02 
 
 
712 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.05 
 
 
695 aa  197  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 
699 aa  194  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4764  chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 
416 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
567 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5231  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 
416 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544234  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  45.13 
 
 
438 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
714 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 
566 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.78 
 
 
716 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
688 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.27 
 
 
563 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
674 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
566 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
560 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  29.26 
 
 
712 aa  184  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
562 aa  184  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
560 aa  183  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.24 
 
 
814 aa  183  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
673 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.58 
 
 
793 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
675 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 
567 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
568 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  29.01 
 
 
714 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
712 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.75 
 
 
486 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
572 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
561 aa  178  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  43.12 
 
 
561 aa  178  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
565 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
559 aa  177  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
563 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  42.7 
 
 
656 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  28.37 
 
 
714 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
672 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
564 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 
566 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 
563 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.12 
 
 
587 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
568 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
573 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  43.22 
 
 
565 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 
561 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 
563 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
656 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
681 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
688 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 
688 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  43.07 
 
 
602 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  42.7 
 
 
552 aa  173  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.97 
 
 
568 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
565 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
561 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.43 
 
 
561 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
565 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
690 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.45 
 
 
716 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 
681 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
563 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
568 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
712 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
711 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1053  chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 
520 aa  171  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
561 aa  171  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  45.65 
 
 
698 aa  170  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.49 
 
 
542 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4246  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  43.49 
 
 
689 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
688 aa  170  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.05 
 
 
688 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
689 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 
586 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
712 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 
688 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 
688 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.15 
 
 
428 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 
558 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
667 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 
698 aa  168  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 
418 aa  168  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0919893  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.74 
 
 
843 aa  168  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3616  chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
305 aa  168  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460138  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  41.52 
 
 
697 aa  168  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
562 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0448901  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  42.12 
 
 
556 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>