More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6993 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  100 
 
 
697 aa  1395    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  35.82 
 
 
688 aa  323  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  40 
 
 
691 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.52 
 
 
563 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.52 
 
 
573 aa  283  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
567 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 
562 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
655 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 
691 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  37.2 
 
 
698 aa  280  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
712 aa  280  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  47.07 
 
 
688 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
563 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
688 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 
691 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
688 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.39 
 
 
673 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  45.78 
 
 
563 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
712 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
670 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 
567 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  48.28 
 
 
552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
566 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
560 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
698 aa  269  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
563 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
566 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
563 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
587 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
568 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
688 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4246  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  31.61 
 
 
689 aa  265  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.44 
 
 
561 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
566 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
672 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  34.41 
 
 
707 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
561 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 
712 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 
674 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
566 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  45.41 
 
 
565 aa  263  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  45.71 
 
 
565 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.64 
 
 
602 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.79 
 
 
563 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 
711 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
577 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
675 aa  260  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
656 aa  260  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
698 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
563 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
563 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
561 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 
731 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
563 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
561 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
656 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
564 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.11 
 
 
561 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.53 
 
 
586 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
561 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
656 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
561 aa  253  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.76 
 
 
730 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
567 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  44.32 
 
 
682 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 
681 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.75 
 
 
542 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0713  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
685 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.862704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
563 aa  252  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
730 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.95 
 
 
561 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
563 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
568 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
563 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.11 
 
 
562 aa  251  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 
562 aa  251  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
561 aa  251  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
563 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
572 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
686 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 
561 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
674 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
714 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 
562 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4203  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 
698 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230185  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
566 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 
608 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
563 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
567 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 
561 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 
564 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
556 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.4 
 
 
716 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.38 
 
 
667 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  48.3 
 
 
716 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>