More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2484 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
563 aa  1100    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
562 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
563 aa  355  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
568 aa  330  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.21 
 
 
568 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 
566 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
562 aa  316  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
566 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  39.59 
 
 
568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  38.28 
 
 
565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.58 
 
 
565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 
563 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
711 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  38.14 
 
 
561 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 
561 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 
672 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  51.71 
 
 
561 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.78 
 
 
572 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  50.57 
 
 
608 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.01 
 
 
675 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.36 
 
 
573 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
561 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 
712 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
561 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.91 
 
 
561 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
688 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 
712 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 
673 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50.57 
 
 
558 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 
566 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  46.21 
 
 
688 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.55 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.08 
 
 
670 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 
689 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.45 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  48.38 
 
 
674 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
688 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  37.9 
 
 
566 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 
563 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 
674 aa  283  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 
694 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 
567 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
712 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
662 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
563 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.98 
 
 
542 aa  280  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
563 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.38 
 
 
563 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 
563 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
602 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  48.62 
 
 
691 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  49.18 
 
 
676 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
561 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.33 
 
 
563 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.03 
 
 
564 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.23 
 
 
691 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.14 
 
 
566 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 
563 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 
563 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 
561 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
563 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
561 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 
560 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
688 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  39 
 
 
563 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 
561 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
669 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.38 
 
 
567 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
691 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
556 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.42 
 
 
565 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0248904 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.88 
 
 
565 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
562 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
556 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
689 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 
561 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 
560 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0667  chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
565 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.510632  normal  0.195802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.25 
 
 
561 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  46.65 
 
 
688 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
559 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  37.48 
 
 
562 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
656 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.71 
 
 
556 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 
557 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
563 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 
561 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0713  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
685 aa  266  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.862704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
656 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
567 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 
698 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.03 
 
 
562 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 
562 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  45.15 
 
 
698 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
562 aa  264  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 
565 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 
562 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0245477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>