More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2078 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  86.99 
 
 
561 aa  949    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
561 aa  1108    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
562 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.17 
 
 
562 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 
561 aa  340  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
561 aa  337  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.97 
 
 
566 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
563 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
561 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
563 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  37.65 
 
 
561 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
566 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 
563 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.41 
 
 
573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
563 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 
563 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.96 
 
 
561 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
561 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
563 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
563 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
655 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 
564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  55.24 
 
 
608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  39.21 
 
 
566 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  46.12 
 
 
565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 
563 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 
556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  55.24 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
563 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 
560 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  45.99 
 
 
565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  37.99 
 
 
563 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 
563 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.65 
 
 
563 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
562 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
563 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 
563 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
563 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.6 
 
 
567 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
568 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  39.28 
 
 
561 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
558 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
558 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
562 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.1 
 
 
566 aa  294  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 
561 aa  293  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 
558 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.11 
 
 
694 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
563 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
672 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  52.16 
 
 
707 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  49.44 
 
 
691 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
688 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 
566 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.59 
 
 
675 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 
562 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
688 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
673 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
562 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
688 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  47.4 
 
 
688 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
674 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  49.46 
 
 
559 aa  286  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.7 
 
 
656 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  48.46 
 
 
682 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.91 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
567 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 
689 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.73 
 
 
565 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
656 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
561 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2555  chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
561 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.834906  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0667  chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 
565 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.510632  normal  0.195802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.99 
 
 
542 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
572 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
565 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0248904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.99 
 
 
691 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
602 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
656 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
561 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0198477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 
674 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.89 
 
 
656 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
691 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
561 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4068  chemotaxis sensory transducer  41.59 
 
 
591 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269414  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3665  chemotaxis sensory transducer  49.15 
 
 
567 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.65 
 
 
731 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
689 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  38.97 
 
 
564 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
670 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
567 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
651 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.94 
 
 
568 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 
688 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
681 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0713  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
685 aa  274  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.862704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>