More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0158 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
561 aa  1113    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 
573 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 
567 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
563 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 
561 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
560 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
567 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 
563 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
559 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 
561 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
560 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 
561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 
586 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
566 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.39 
 
 
559 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.11 
 
 
562 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
736 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.19 
 
 
565 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 
561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1583  chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
583 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.105257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
608 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.89 
 
 
565 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.92 
 
 
561 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.93 
 
 
558 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.61 
 
 
558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
575 aa  309  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1584  chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 
556 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  49.32 
 
 
688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.46 
 
 
562 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 
579 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 
688 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
688 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  34.77 
 
 
661 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  48.76 
 
 
565 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 
689 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.88 
 
 
688 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 
572 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  48.29 
 
 
688 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.61 
 
 
542 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  49.04 
 
 
565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 
566 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 
562 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
675 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 
655 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.19 
 
 
562 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  48.03 
 
 
552 aa  280  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 
562 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
566 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
655 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.87 
 
 
656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
674 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
602 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
690 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1109  chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
566 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  35.62 
 
 
661 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
672 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 
561 aa  273  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  47.55 
 
 
566 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.65 
 
 
567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
561 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
673 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.98 
 
 
562 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
674 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
711 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.96 
 
 
730 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 
561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.16 
 
 
694 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
561 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 
712 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  44.69 
 
 
656 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 
656 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.46 
 
 
556 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
561 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  47.21 
 
 
556 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
563 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
674 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.7 
 
 
568 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
561 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  46.24 
 
 
561 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
712 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
587 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  46.24 
 
 
676 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
561 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
681 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
686 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
567 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
644 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
670 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
656 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
662 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
561 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
549 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.482626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 
698 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
568 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.88 
 
 
568 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  45.5 
 
 
577 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>