More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4246 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4246  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  100 
 
 
689 aa  1367    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  33.38 
 
 
688 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  31.52 
 
 
697 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.65 
 
 
563 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
562 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  47.26 
 
 
565 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
563 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 
573 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.14 
 
 
561 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  43.67 
 
 
565 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
563 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.7 
 
 
561 aa  250  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
672 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.04 
 
 
542 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
563 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 
563 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  46 
 
 
552 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
563 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.91 
 
 
563 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
608 aa  247  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
563 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 
567 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
674 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
564 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
673 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 
563 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 
559 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 
561 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
561 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 
698 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.41 
 
 
558 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
577 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
674 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 
561 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.47 
 
 
563 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
691 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
566 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.01 
 
 
656 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 
566 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  44.48 
 
 
562 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
561 aa  239  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
567 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.78 
 
 
563 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
561 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 
714 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
563 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
563 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  45.22 
 
 
707 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  33.89 
 
 
691 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
731 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.16 
 
 
562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.12 
 
 
691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 
688 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
566 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
730 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  43.52 
 
 
688 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
711 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
587 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 
686 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
670 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.33 
 
 
561 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
712 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
741 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
561 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
558 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
568 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
565 aa  231  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
561 aa  231  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.79 
 
 
568 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
712 aa  231  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4203  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 
698 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230185  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
561 aa  230  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
675 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  41.91 
 
 
662 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  43.04 
 
 
675 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  35.54 
 
 
698 aa  228  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
730 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
559 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 
698 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
689 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 
565 aa  227  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.06 
 
 
716 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
565 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
561 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  41.51 
 
 
688 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
566 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 
565 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
566 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
653 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
688 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
681 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>