More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2366 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
560 aa  1106    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
561 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
567 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 
573 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 
563 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 
559 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
567 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
563 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
565 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 
586 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
736 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 
575 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 
559 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
562 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.55 
 
 
661 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3836  Cache, type 2  38 
 
 
661 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
608 aa  297  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 
561 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 
561 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
558 aa  293  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.9 
 
 
558 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 
560 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.94 
 
 
579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.45 
 
 
712 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  49.19 
 
 
565 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.64 
 
 
565 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1583  chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
583 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.105257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1584  chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 
556 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.53 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.45 
 
 
563 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
563 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.35 
 
 
561 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
712 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.4 
 
 
572 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.91 
 
 
566 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
688 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 
566 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  46.68 
 
 
561 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.54 
 
 
563 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 
565 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
549 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.482626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
711 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
563 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
688 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.36 
 
 
691 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
691 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 
741 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.25 
 
 
561 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 
561 aa  259  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
566 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  48.25 
 
 
561 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
563 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
563 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  46.4 
 
 
565 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
675 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.98 
 
 
689 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.97 
 
 
563 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 
563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
563 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
688 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.56 
 
 
562 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 
568 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
563 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 
712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  46.65 
 
 
688 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
672 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
577 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
656 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 
561 aa  253  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 
564 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
561 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.2 
 
 
602 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  48.8 
 
 
707 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  48.07 
 
 
561 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.19 
 
 
688 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 
561 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
655 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
674 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
553 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
731 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
563 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 
656 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 
674 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
673 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
563 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  49.25 
 
 
562 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.87 
 
 
691 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.11 
 
 
542 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
561 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
561 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  37.43 
 
 
552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  52.2 
 
 
438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 
730 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.73 
 
 
564 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  42.34 
 
 
656 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  46.63 
 
 
698 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>