More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2460 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
565 aa  1116    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1109  chemotaxis sensory transducer  56.66 
 
 
566 aa  538  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
573 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.78 
 
 
563 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 
567 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 
736 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 
563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
559 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
562 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
567 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
566 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
561 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
586 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 
561 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
608 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  45.28 
 
 
565 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.53 
 
 
562 aa  267  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  35.7 
 
 
661 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 
560 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.61 
 
 
558 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 
575 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 
731 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 
561 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
558 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
656 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 
561 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
561 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 
566 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
673 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 
560 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 
672 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 
559 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
656 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  34.73 
 
 
565 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 
741 aa  253  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  43.47 
 
 
565 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 
561 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
566 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
561 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 
579 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
567 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.93 
 
 
674 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
655 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
566 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.31 
 
 
730 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.8 
 
 
716 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.17 
 
 
542 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
656 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 
563 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 
567 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
602 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  46.2 
 
 
552 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
656 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
561 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  43.85 
 
 
568 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  42.42 
 
 
688 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  42.67 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
694 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
563 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
670 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
563 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
561 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
714 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
562 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 
587 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  42.97 
 
 
688 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  42.74 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.61 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
563 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
565 aa  239  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 
450 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
675 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
688 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 
565 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.55 
 
 
688 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
561 aa  238  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  42.05 
 
 
697 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.71 
 
 
674 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  43.83 
 
 
688 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  43.08 
 
 
669 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 
564 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
681 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  43.23 
 
 
690 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.89 
 
 
560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1583  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
583 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.105257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  44.08 
 
 
691 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  44.14 
 
 
577 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.75 
 
 
561 aa  233  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
563 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  47.71 
 
 
707 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0667  chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
565 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.510632  normal  0.195802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  42.05 
 
 
676 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.78 
 
 
568 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
562 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
563 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>