More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2546 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
690 aa  1376    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 
688 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
731 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 
741 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 
730 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 
730 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.43 
 
 
562 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.72 
 
 
573 aa  300  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 
567 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5329  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
691 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  48.65 
 
 
565 aa  296  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  48.23 
 
 
688 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.46 
 
 
688 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
688 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  40.04 
 
 
566 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
688 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  47.12 
 
 
656 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.71 
 
 
568 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  44.91 
 
 
565 aa  283  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.12 
 
 
689 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.29 
 
 
675 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
572 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 
586 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 
657 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
656 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
656 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.5 
 
 
566 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 
602 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  46.93 
 
 
561 aa  277  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
563 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  47.96 
 
 
568 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.25 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
670 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.01 
 
 
542 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.89 
 
 
561 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.08 
 
 
655 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  46.99 
 
 
552 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.68 
 
 
567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  48.42 
 
 
707 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
566 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.75 
 
 
689 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 
563 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
674 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 
561 aa  269  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
672 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
673 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
561 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.97 
 
 
568 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 
561 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 
674 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 
587 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  46.36 
 
 
698 aa  264  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  48.42 
 
 
561 aa  264  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
577 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
566 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
561 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 
655 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 
561 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  45.83 
 
 
688 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  44.83 
 
 
675 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  45.22 
 
 
565 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
559 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
567 aa  260  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
562 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.06 
 
 
559 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
563 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
694 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
563 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
563 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 
561 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
565 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 
567 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.76 
 
 
562 aa  256  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 
698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.29 
 
 
681 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
686 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  40.37 
 
 
676 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 
568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
561 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
560 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
565 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
662 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
562 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
568 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.05 
 
 
561 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
561 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
681 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  41.41 
 
 
697 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  44.99 
 
 
561 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.99 
 
 
564 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  44.51 
 
 
682 aa  251  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 
556 aa  250  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  45.27 
 
 
691 aa  249  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.34 
 
 
556 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
698 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
562 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2555  chemotaxis sensory transducer  46.56 
 
 
561 aa  249  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.834906  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 
563 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>