More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0957 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
549 aa  1057    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.482626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  41.44 
 
 
566 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 
565 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.5 
 
 
579 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
561 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 
561 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
560 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
573 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
561 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
563 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
561 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
567 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
561 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
562 aa  309  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
563 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
563 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.65 
 
 
566 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
563 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 
559 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 
563 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.84 
 
 
563 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
557 aa  293  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
565 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.75 
 
 
566 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.72 
 
 
560 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.76 
 
 
563 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
567 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
608 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
566 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.14 
 
 
561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
553 aa  287  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.85 
 
 
558 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.92 
 
 
562 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  46.79 
 
 
688 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.24 
 
 
561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.45 
 
 
575 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.92 
 
 
563 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.28 
 
 
561 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.83 
 
 
563 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 
655 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.83 
 
 
561 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.64 
 
 
663 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
694 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  51.55 
 
 
561 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.33 
 
 
688 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
563 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.81 
 
 
688 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.98 
 
 
689 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
681 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
568 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.4 
 
 
656 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 
567 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
675 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.69 
 
 
562 aa  272  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
567 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 
559 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 
558 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
566 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.53 
 
 
656 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
562 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 
563 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
561 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.46 
 
 
564 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 
688 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
562 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4791  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.71 
 
 
563 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.685315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
568 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 
667 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  46.03 
 
 
656 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.26 
 
 
561 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 
562 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.01 
 
 
538 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
563 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
562 aa  266  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
558 aa  266  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 
602 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
558 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
556 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
556 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.395485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  45.62 
 
 
714 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
672 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
670 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  43.89 
 
 
563 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
561 aa  264  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  50.14 
 
 
691 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  45.97 
 
 
656 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0370  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.29 
 
 
560 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.52335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
674 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 
673 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  45.7 
 
 
565 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
563 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 
561 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  36.4 
 
 
736 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>