More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1802 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
438 aa  873    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.12 
 
 
428 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
425 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  68.06 
 
 
568 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.79 
 
 
562 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.8 
 
 
674 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
675 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.47 
 
 
567 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.26 
 
 
568 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  53.45 
 
 
565 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.42 
 
 
567 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.15 
 
 
563 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
561 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.76 
 
 
688 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  53.1 
 
 
565 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  53.9 
 
 
674 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 
688 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  48.63 
 
 
552 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.47 
 
 
672 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.47 
 
 
673 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  52.76 
 
 
688 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  52.43 
 
 
656 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.29 
 
 
689 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 
573 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 
563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.1 
 
 
716 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.04 
 
 
691 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.08 
 
 
561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.89 
 
 
731 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  51.38 
 
 
564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  55.93 
 
 
691 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  51.21 
 
 
656 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.9 
 
 
670 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.07 
 
 
563 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  52.92 
 
 
602 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  51.33 
 
 
563 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  52.78 
 
 
688 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 
561 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.25 
 
 
566 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  53.36 
 
 
561 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
561 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
566 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.08 
 
 
560 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.45 
 
 
741 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.6 
 
 
563 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.25 
 
 
572 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  53.74 
 
 
691 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  52.08 
 
 
676 aa  249  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.71 
 
 
563 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  52.41 
 
 
561 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.2 
 
 
566 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.02 
 
 
730 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  51.08 
 
 
556 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  52.25 
 
 
563 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 
568 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.74 
 
 
542 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  51.5 
 
 
561 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  52.67 
 
 
561 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.67 
 
 
655 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  53.12 
 
 
577 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 
563 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  54.21 
 
 
559 aa  246  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 
558 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 
561 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 
558 aa  246  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.68 
 
 
561 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  49.37 
 
 
688 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.2 
 
 
560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.3 
 
 
561 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.69 
 
 
656 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.53 
 
 
568 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.74 
 
 
586 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
965 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.63 
 
 
565 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.44 
 
 
563 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.74 
 
 
587 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.06 
 
 
694 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 
698 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  54.81 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  49.83 
 
 
714 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  54.07 
 
 
562 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  52.8 
 
 
675 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.83 
 
 
562 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  52.78 
 
 
716 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.17 
 
 
567 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.56 
 
 
563 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.39 
 
 
561 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.87 
 
 
563 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
564 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53 
 
 
561 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.25 
 
 
730 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.59 
 
 
563 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  50.35 
 
 
698 aa  236  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.78 
 
 
561 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  49.67 
 
 
566 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.45 
 
 
566 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.79 
 
 
558 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.176129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.06 
 
 
656 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.09 
 
 
561 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.38 
 
 
565 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0248904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>