More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1909 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
965 aa  1973    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05860  methyl-accepting chemotaxis protein  50.58 
 
 
517 aa  351  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0376  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  48.5 
 
 
520 aa  339  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.984009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 
532 aa  338  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.857744  normal  0.045525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  48.96 
 
 
522 aa  331  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 
517 aa  329  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153757  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1053  chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 
520 aa  277  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.64 
 
 
561 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  55.19 
 
 
691 aa  269  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 
730 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.93 
 
 
563 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.81 
 
 
563 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.88 
 
 
674 aa  265  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.96 
 
 
672 aa  265  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.96 
 
 
688 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.81 
 
 
563 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
675 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.76 
 
 
566 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.01 
 
 
572 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  53.24 
 
 
688 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.28 
 
 
562 aa  260  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.41 
 
 
566 aa  260  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
567 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.19 
 
 
730 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 
656 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
731 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.88 
 
 
688 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 
673 aa  258  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  52.36 
 
 
656 aa  257  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 
656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 
689 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  52.88 
 
 
674 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  52.73 
 
 
568 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.01 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  54.01 
 
 
561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.38 
 
 
564 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.52 
 
 
567 aa  254  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
438 aa  254  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.4 
 
 
560 aa  254  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  51.08 
 
 
716 aa  254  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 
688 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.38 
 
 
556 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 
563 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  51.8 
 
 
565 aa  253  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.52 
 
 
670 aa  253  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
449 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
573 aa  253  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.18 
 
 
655 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.11 
 
 
562 aa  251  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  54.12 
 
 
566 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 
563 aa  251  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  52.19 
 
 
565 aa  250  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.62 
 
 
563 aa  251  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.38 
 
 
562 aa  250  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.18 
 
 
562 aa  250  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  54.38 
 
 
562 aa  250  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.59 
 
 
587 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  52.59 
 
 
563 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.25 
 
 
904 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  51.85 
 
 
691 aa  248  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  52.59 
 
 
561 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  51.27 
 
 
552 aa  247  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.81 
 
 
566 aa  247  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.01 
 
 
561 aa  247  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  49.64 
 
 
676 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.36 
 
 
561 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
561 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.27 
 
 
565 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.48 
 
 
691 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 
565 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0667  chemotaxis sensory transducer  52.9 
 
 
565 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.510632  normal  0.195802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 
561 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 
602 aa  244  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.9 
 
 
565 aa  244  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0248904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.07 
 
 
565 aa  243  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
561 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.09 
 
 
562 aa  243  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.48 
 
 
563 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  54.07 
 
 
563 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3616  chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 
305 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460138  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  51.85 
 
 
563 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.33 
 
 
563 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.7 
 
 
563 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  49.67 
 
 
545 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  52.73 
 
 
577 aa  241  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.48 
 
 
486 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.64 
 
 
562 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0191  chemotaxis sensory transducer  55.43 
 
 
565 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2072  chemotaxis sensory transducer  53.45 
 
 
556 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68132  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.52 
 
 
568 aa  240  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
741 aa  240  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  53.53 
 
 
688 aa  240  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.91 
 
 
542 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 
698 aa  240  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.36 
 
 
586 aa  240  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4505  PAS sensor protein  39.24 
 
 
486 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.778246  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.91 
 
 
561 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  52.96 
 
 
608 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.24 
 
 
486 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  47.48 
 
 
714 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>