More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1710 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
449 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.78 
 
 
450 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 
688 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  58.87 
 
 
565 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.95 
 
 
561 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
656 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.19 
 
 
562 aa  279  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
566 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.14 
 
 
672 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  57.99 
 
 
565 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.55 
 
 
689 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  55.52 
 
 
566 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
445 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.74 
 
 
566 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
567 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.15 
 
 
731 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.91 
 
 
688 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 
688 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.82 
 
 
563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.8 
 
 
568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  56.94 
 
 
656 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
565 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.27 
 
 
542 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.1 
 
 
673 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.74 
 
 
675 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
674 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  58.27 
 
 
688 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3616  chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
305 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460138  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
561 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
561 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.54 
 
 
716 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.81 
 
 
563 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  56.06 
 
 
561 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  56.03 
 
 
552 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.46 
 
 
563 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  57.8 
 
 
561 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
561 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.8 
 
 
670 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
560 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.22 
 
 
561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.42 
 
 
741 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.67 
 
 
573 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
561 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.93 
 
 
563 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
561 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  55.05 
 
 
674 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.16 
 
 
556 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.8 
 
 
568 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.58 
 
 
730 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.21 
 
 
567 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.09 
 
 
563 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  49.12 
 
 
714 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
587 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.51 
 
 
565 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620524  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.9 
 
 
730 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
655 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 
445 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.73 
 
 
656 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.8 
 
 
564 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.71 
 
 
565 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.07 
 
 
562 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.35 
 
 
563 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  56.74 
 
 
577 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.67 
 
 
568 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.22 
 
 
698 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.97 
 
 
563 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.8 
 
 
565 aa  259  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
566 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.25 
 
 
656 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.68 
 
 
564 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.96 
 
 
572 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0191  chemotaxis sensory transducer  57.45 
 
 
565 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2363  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.79 
 
 
695 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.39 
 
 
694 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  56.34 
 
 
675 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.12 
 
 
651 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.72 
 
 
563 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  56.62 
 
 
691 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.79 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.09 
 
 
563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2708  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.45 
 
 
696 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674681  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  54.33 
 
 
691 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.72 
 
 
564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3081  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.57 
 
 
562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53055  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  58.46 
 
 
563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  53.44 
 
 
558 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  57.8 
 
 
716 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
428 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.44 
 
 
558 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.9 
 
 
562 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.81 
 
 
562 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0245477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
565 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  55.36 
 
 
562 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  55.51 
 
 
563 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3409  chemotaxis sensory transducer  56.38 
 
 
651 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304746  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.63 
 
 
691 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  55.32 
 
 
602 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.26 
 
 
561 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.9 
 
 
565 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0248904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.92 
 
 
681 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>